Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G064800.1,Sobic.008G064800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBM7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G135366 - -
2 Sobic.002G243300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G092400 amino acid transporter, putative, expressed -
4 Sobic.003G410300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G003600 - -
6 Sobic.002G034750 - -
7 Sobic.004G349450 - -
8 Sobic.005G017700 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G131550 - -
10 Sobic.002G212300 - -
11 Sobic.001G504500 expressed protein -
12 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
13 Sobic.009G044700 DTA2, putative, expressed -
14 Sobic.002G251300 uroporphyrinogen-III synthase, putative, expressed -
15 Sobic.009G085300 - -
16 Sobic.010G225201 - -
17 Sobic.001G281201 - -
18 Sobic.008G054200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@csAtPR5, putative, expressed -
19 Sobic.006G162400 expressed protein -
20 Sobic.004G046800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G064800 Sobic008G064800 Sobic004G135366 Sobic004G135366 Sobic008G064800--Sobic004G135366 Sobic002G243300 Sobic002G243300 Sobic008G064800--Sobic002G243300 Sobic007G092400 Sobic007G092400 Sobic008G064800--Sobic007G092400 Sobic003G410300 Sobic003G410300 Sobic008G064800--Sobic003G410300 Sobic005G003600 Sobic005G003600 Sobic008G064800--Sobic005G003600 Sobic002G034750 Sobic002G034750 Sobic008G064800--Sobic002G034750 Sobic004G349450 Sobic004G349450 Sobic008G064800--Sobic004G349450 Sobic005G017700 Sobic005G017700 Sobic008G064800--Sobic005G017700 Sobic005G131550 Sobic005G131550 Sobic008G064800--Sobic005G131550 Sobic004G135366--Sobic002G243300 Sobic004G135366--Sobic004G349450 Sobic009G206100 Sobic009G206100 Sobic004G135366--Sobic009G206100 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic004G135366--Sobic007G063800 Sobic008G082000 Sobic008G082000 Sobic004G135366--Sobic008G082000 Sobic002G350200 Sobic002G350200 Sobic004G135366--Sobic002G350200 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic004G135366--Sobic008G056600 Sobic007G127800 Sobic007G127800 Sobic004G135366--Sobic007G127800 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic004G135366--Sobic010G038300 Sobic002G243300--Sobic004G349450 Sobic005G055700 Sobic005G055700 Sobic002G243300--Sobic005G055700 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic002G243300--Sobic007G112500 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic002G243300--Sobic005G043300 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic002G243300--Sobic003G014200 Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic002G243300--Sobic008G076100 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic002G243300--Sobic003G111000 Sobic005G185900 Sobic005G185900 Sobic002G243300--Sobic005G185900 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic002G243300--Sobic002G073600 Sobic007G092400--Sobic003G410300 Sobic007G092400--Sobic004G135366 Sobic007G092400--Sobic002G034750 Sobic004G089300 Sobic004G089300 Sobic007G092400--Sobic004G089300 Sobic003G038400 Sobic003G038400 Sobic007G092400--Sobic003G038400 Sobic009G085300 Sobic009G085300 Sobic007G092400--Sobic009G085300 Sobic002G349900 Sobic002G349900 Sobic007G092400--Sobic002G349900 Sobic007G092400--Sobic002G243300 Sobic007G092400--Sobic005G003600 Sobic003G410300--Sobic007G092400 Sobic003G410300--Sobic009G085300 Sobic009G044700 Sobic009G044700 Sobic003G410300--Sobic009G044700 Sobic003G410300--Sobic002G034750 Sobic003G008000 Sobic003G008000 Sobic003G410300--Sobic003G008000 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic003G410300--Sobic010G104600 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic003G410300--Sobic001G453600 Sobic003G410300--Sobic002G243300 Sobic003G410300--Sobic004G135366 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic005G003600--Sobic001G539400 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic005G003600--Sobic004G046800 Sobic005G003600--Sobic001G453600 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic005G003600--Sobic008G124600 Sobic003G065201 Sobic003G065201 Sobic005G003600--Sobic003G065201 Sobic001G504700 Sobic001G504700 Sobic005G003600--Sobic001G504700 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic005G003600--Sobic006G162400 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic005G003600--Sobic009G229400 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic005G003600--Sobic010G145100 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic002G034750--Sobic010G225201 Sobic002G034750--Sobic004G349450 Sobic003G212000 Sobic003G212000 Sobic002G034750--Sobic003G212000 Sobic002G034750--Sobic002G243300 Sobic003G234500 Sobic003G234500 Sobic002G034750--Sobic003G234500 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic002G034750--Sobic008G071300 Sobic006G120900 Sobic006G120900 Sobic002G034750--Sobic006G120900 Sobic002G034750--Sobic003G008000 Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic002G034750--Sobic001G504500 Sobic004G349450--Sobic007G112500 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic004G349450--Sobic004G052600 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic004G349450--Sobic006G017900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G349450--Sobic006G017700 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic004G349450--Sobic001G211700 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic004G349450--Sobic008G036100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic004G349450--Sobic005G000900 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic004G349450--Sobic004G046700 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic004G349450--Sobic004G328500 Sobic001G259500 Sobic001G259500 Sobic005G017700--Sobic001G259500 Sobic002G394300 Sobic002G394300 Sobic005G017700--Sobic002G394300 Sobic005G017700--Sobic008G064800 Sobic002G269032 Sobic002G269032 Sobic005G017700--Sobic002G269032 Sobic005G017700--Sobic004G135366 Sobic005G131550--Sobic001G504500 Sobic005G131550--Sobic004G349450 Sobic002G280950 Sobic002G280950 Sobic005G131550--Sobic002G280950 Sobic005G131550--Sobic002G243300 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic005G131550--Sobic003G079532 Sobic004G189000 Sobic004G189000 Sobic005G131550--Sobic004G189000 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic005G131550--Sobic003G211233 Sobic005G131550--Sobic001G453600 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic005G131550--Sobic007G220150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.