Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G251300.1
Synonym Sb02g028710
Functional annotation uroporphyrinogen-III synthase, putative, expressed
UniProt C5X4I7
Pfam PF02602
Panther DB PTHR38020
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004852; uroporphyrinogen-III synthase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g32025.1 : uroporphyrinogen-III synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014235
Brachypodium KQJ90812
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G251300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.008G128500 - -
20 Sobic.009G156100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G251300 Sobic002G251300 Sobic007G157500 Sobic007G157500 Sobic002G251300--Sobic007G157500 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic002G251300--Sobic005G170000 Sobic007G143250 Sobic007G143250 Sobic002G251300--Sobic007G143250 Sobic006G216900 Sobic006G216900 Sobic002G251300--Sobic006G216900 Sobic003G410300 Sobic003G410300 Sobic002G251300--Sobic003G410300 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic002G251300--Sobic001G453600 Sobic007G049900 Sobic007G049900 Sobic002G251300--Sobic007G049900 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic002G251300--Sobic010G225201 Sobic008G065600 Sobic008G065600 Sobic002G251300--Sobic008G065600 Sobic007G157500--Sobic002G251300 Sobic003G242700 Sobic003G242700 Sobic007G157500--Sobic003G242700 Sobic004G016100 Sobic004G016100 Sobic007G157500--Sobic004G016100 Sobic007G157500--Sobic007G143250 Sobic006G005200 Sobic006G005200 Sobic007G157500--Sobic006G005200 Sobic008G128500 Sobic008G128500 Sobic007G157500--Sobic008G128500 Sobic002G138300 Sobic002G138300 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Octagon: transcription factors


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