Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G065600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R522
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.008G065600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G006500 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
2 Sobic.009G142400 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
3 Sobic.001G504700 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G240200 - -
5 Sobic.005G003600 - -
6 Sobic.005G201400 OsFBX222 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G278900 - -
8 Sobic.008G124600 expressed protein -
9 Sobic.002G295600 - -
10 Sobic.007G171700 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1
11 Sobic.003G001901 - -
12 Sobic.005G173700 - -
13 Sobic.001G272400 - -
14 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
15 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
16 Sobic.003G218000 ENT domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G007700 expressed protein -
18 Sobic.006G256400 expressed protein -
19 Sobic.004G355750 - -
20 Sobic.003G410300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G065600 Sobic008G065600 Sobic002G006500 Sobic002G006500 Sobic008G065600--Sobic002G006500 Sobic009G142400 Sobic009G142400 Sobic008G065600--Sobic009G142400 Sobic001G504700 Sobic001G504700 Sobic008G065600--Sobic001G504700 Sobic009G240200 Sobic009G240200 Sobic008G065600--Sobic009G240200 Sobic005G003600 Sobic005G003600 Sobic008G065600--Sobic005G003600 Sobic005G201400 Sobic005G201400 Sobic008G065600--Sobic005G201400 Sobic002G278900 Sobic002G278900 Sobic008G065600--Sobic002G278900 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic008G065600--Sobic008G124600 Sobic002G295600 Sobic002G295600 Sobic008G065600--Sobic002G295600 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic002G006500--Sobic007G171700 Sobic002G006500--Sobic005G201400 Sobic003G090400 Sobic003G090400 Sobic002G006500--Sobic003G090400 Sobic009G240500 Sobic009G240500 Sobic002G006500--Sobic009G240500 Sobic010G051800 Sobic010G051800 Sobic002G006500--Sobic010G051800 Sobic001G242200 Sobic001G242200 Sobic002G006500--Sobic001G242200 Sobic003G001901 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Octagon: transcription factors


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