Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G272900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VV40
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G255900 DNL zinc finger domain containing protein, putative, expressed K17808: ZIM17, DNLZ, mitochondrial protein import protein ZIM17
2 Sobic.009G156100 - -
3 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.007G077532 - K08597: SENP8, NEDP1, sentrin-specific protease 8
5 Sobic.001G057400 expressed protein -
6 Sobic.004G111600 - -
7 Sobic.008G069300 - -
8 Sobic.001G136600 serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit Bgamma isoform, putative, expressed K11584: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'
9 Sobic.005G185500 - -
10 Sobic.005G170000 expressed protein -
11 Sobic.006G005200 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
12 Sobic.003G428000 expressed protein -
13 Sobic.003G039900 OsFBDUF1 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G162400 expressed protein -
15 Sobic.005G090200 - -
16 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
17 Sobic.004G004100 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G410300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G055500 Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G158000 dolichyl-phosphate beta-glycosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G272900 Sobic010G272900 Sobic010G255900 Sobic010G255900 Sobic010G272900--Sobic010G255900 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic010G272900--Sobic009G156100 Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic010G272900--Sobic003G377500 Sobic007G077532 Sobic007G077532 Sobic010G272900--Sobic007G077532 Sobic001G057400 Sobic001G057400 Sobic010G272900--Sobic001G057400 Sobic004G111600 Sobic004G111600 Sobic010G272900--Sobic004G111600 Sobic008G069300 Sobic008G069300 Sobic010G272900--Sobic008G069300 Sobic001G136600 Sobic001G136600 Sobic010G272900--Sobic001G136600 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic010G272900--Sobic005G185500 Sobic010G255900--Sobic005G185500 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic010G255900--Sobic006G162400 Sobic001G356200 Sobic001G356200 Sobic010G255900--Sobic001G356200 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic010G255900--Sobic003G385300 Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic010G255900--Sobic001G504500 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic010G255900--Sobic001G149000 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic010G255900--Sobic003G117800 Sobic003G353700 Sobic003G353700 Sobic010G255900--Sobic003G353700 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic010G255900--Sobic003G428000 Sobic009G156100--Sobic003G377500 Sobic004G068100 Sobic004G068100 Sobic009G156100--Sobic004G068100 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic009G156100--Sobic001G114200 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic009G156100--Sobic008G116700 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic009G156100--Sobic006G060000 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic009G156100--Sobic007G076400 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic009G156100--Sobic003G181700 Sobic006G005200 Sobic006G005200 Sobic009G156100--Sobic006G005200 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic009G156100--Sobic002G200000 Sobic003G377500--Sobic009G156100 Sobic003G377500--Sobic001G114200 Sobic003G377500--Sobic006G005200 Sobic003G377500--Sobic008G116700 Sobic003G405600 Sobic003G405600 Sobic003G377500--Sobic003G405600 Sobic003G377500--Sobic002G200000 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic003G377500--Sobic003G402800 Sobic005G090200 Sobic005G090200 Sobic003G377500--Sobic005G090200 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G377500--Sobic008G055500 Sobic004G141400 Sobic004G141400 Sobic007G077532--Sobic004G141400 Sobic007G077532--Sobic001G057400 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic007G077532--Sobic007G192400 Sobic004G004100 Sobic004G004100 Sobic007G077532--Sobic004G004100 Sobic007G077532--Sobic005G185500 Sobic010G181600 Sobic010G181600 Sobic007G077532--Sobic010G181600 Sobic007G077532--Sobic003G353700 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic007G077532--Sobic008G006000 Sobic007G077532--Sobic003G117800 Sobic001G057400--Sobic003G117800 Sobic001G057400--Sobic007G077532 Sobic001G057400--Sobic005G185500 Sobic001G057400--Sobic003G353700 Sobic001G057400--Sobic003G428000 Sobic001G057400--Sobic010G255900 Sobic007G142600 Sobic007G142600 Sobic001G057400--Sobic007G142600 Sobic001G057400--Sobic003G385300 Sobic001G057400--Sobic008G055500 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic004G111600--Sobic009G228400 Sobic004G111600--Sobic007G077532 Sobic004G111600--Sobic001G057400 Sobic004G111600--Sobic004G068100 Sobic004G111600--Sobic003G117800 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic004G111600--Sobic005G123400 Sobic010G112600 Sobic010G112600 Sobic004G111600--Sobic010G112600 Sobic004G111600--Sobic004G004100 Sobic004G111600--Sobic007G192400 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic008G069300--Sobic009G046900 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic008G069300--Sobic002G074800 Sobic008G069300--Sobic003G428000 Sobic009G148600 Sobic009G148600 Sobic008G069300--Sobic009G148600 Sobic010G109800 Sobic010G109800 Sobic008G069300--Sobic010G109800 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic008G069300--Sobic009G229400 Sobic003G198900 Sobic003G198900 Sobic008G069300--Sobic003G198900 Sobic009G156800 Sobic009G156800 Sobic008G069300--Sobic009G156800 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic008G069300--Sobic006G270000 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic001G136600--Sobic004G122900 Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic001G136600--Sobic009G102000 Sobic005G009100 Sobic005G009100 Sobic001G136600--Sobic005G009100 Sobic001G521700 Sobic001G521700 Sobic001G136600--Sobic001G521700 Sobic009G162100 Sobic009G162100 Sobic001G136600--Sobic009G162100 Sobic006G103700 Sobic006G103700 Sobic001G136600--Sobic006G103700 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic001G136600--Sobic002G203600 Sobic005G025300 Sobic005G025300 Sobic001G136600--Sobic005G025300 Sobic001G136600--Sobic009G156100 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic005G185500--Sobic002G389600 Sobic005G185500--Sobic003G385300 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic005G185500--Sobic006G093600 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic005G185500--Sobic007G039200 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic005G185500--Sobic006G001100 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic005G185500--Sobic005G225500 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic005G185500--Sobic002G102300 Sobic006G162500 Sobic006G162500 Sobic005G185500--Sobic006G162500 Sobic005G185500--Sobic003G402800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.