Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G136600.1
Synonym ATB\'BETA, Sb01g011920
Functional annotation serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit Bgamma isoform, putative, expressed
UniProt A0A1B6QIU1
Pfam PF01603
Panther DB PTHR10257 PTHR10257:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11584; serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'
Gene Ontology GO:0007165; signal transduction GO:0000159protein phosphatase type 2A complex


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03470 : Protein phosphatase 2A regulatory B subunit family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g47790.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007438 , Zm00025a017113
Brachypodium KQK13780 , KQK13781
Barley HORVU4Hr1G003930.3 , HORVU4Hr1G003930.2 , HORVU4Hr1G003930.1
Wheat TraesCS4B02G026300 , TraesCS4D02G023700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G136600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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8 Sobic.005G025300 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
9 Sobic.009G156100 - -
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20 Sobic.006G215900 OsFBX172 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G136600 Sobic001G136600 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic001G136600--Sobic004G122900 Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic001G136600--Sobic009G102000 Sobic005G009100 Sobic005G009100 Sobic001G136600--Sobic005G009100 Sobic001G521700 Sobic001G521700 Sobic001G136600--Sobic001G521700 Sobic009G162100 Sobic009G162100 Sobic001G136600--Sobic009G162100 Sobic006G103700 Sobic006G103700 Sobic001G136600--Sobic006G103700 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic001G136600--Sobic002G203600 Sobic005G025300 Sobic005G025300 Sobic001G136600--Sobic005G025300 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic001G136600--Sobic009G156100 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic004G122900--Sobic003G181700 Sobic009G122500 Sobic009G122500 Sobic004G122900--Sobic009G122500 Sobic009G194000 Sobic009G194000 Sobic004G122900--Sobic009G194000 Sobic001G156900 Sobic001G156900 Sobic004G122900--Sobic001G156900 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic004G122900--Sobic001G043200 Sobic001G335000 Sobic001G335000 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Octagon: transcription factors


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