Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G016100.1
Synonym Sb04g001520
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XSE9
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085:SF3 PTHR33085
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2D02G592000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G077532 - K08597: SENP8, NEDP1, sentrin-specific protease 8
2 Sobic.004G259300 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type domain containing protein, expressed K15687: E3 ubiquitin-protein ligase makorin
3 Sobic.007G177500 thaumatin, putative, expressed -
4 Sobic.004G141400 START domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G170000 expressed protein -
6 Sobic.007G192400 zinc ion binding protein, putative, expressed K15196: BRF1, transcription factor IIIB 90 kDa subunit
7 Sobic.003G402900 HYS1, putative, expressed -
8 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
9 Sobic.004G218300 Zinc finger, ZZ type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G335201 - -
11 Sobic.007G184800 transcription factor RF2a, putative, expressed -
12 Sobic.006G252400 S4 domain containing protein, putative, expressed K14560: U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3
13 Sobic.008G006000 expressed protein -
14 Sobic.004G042900 VIL2 protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G009100 OsFBX184 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G127300 - -
17 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144
18 Sobic.004G068100 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
19 Sobic.003G005100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
20 Sobic.007G221500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G016100 Sobic004G016100 Sobic007G077532 Sobic007G077532 Sobic004G016100--Sobic007G077532 Sobic004G259300 Sobic004G259300 Sobic004G016100--Sobic004G259300 Sobic007G177500 Sobic007G177500 Sobic004G016100--Sobic007G177500 Sobic004G141400 Sobic004G141400 Sobic004G016100--Sobic004G141400 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic004G016100--Sobic005G170000 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic004G016100--Sobic007G192400 Sobic003G402900 Sobic003G402900 Sobic004G016100--Sobic003G402900 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic004G016100--Sobic009G228400 Sobic004G218300 Sobic004G218300 Sobic004G016100--Sobic004G218300 Sobic007G077532--Sobic004G141400 Sobic001G057400 Sobic001G057400 Sobic007G077532--Sobic001G057400 Sobic007G077532--Sobic007G192400 Sobic004G004100 Sobic004G004100 Sobic007G077532--Sobic004G004100 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic007G077532--Sobic005G185500 Sobic010G181600 Sobic010G181600 Sobic007G077532--Sobic010G181600 Sobic003G353700 Sobic003G353700 Sobic007G077532--Sobic003G353700 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic007G077532--Sobic008G006000 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic007G077532--Sobic003G117800 Sobic004G259300--Sobic004G218300 Sobic004G259300--Sobic004G141400 Sobic004G259300--Sobic007G192400 Sobic003G250400 Sobic003G250400 Sobic004G259300--Sobic003G250400 Sobic007G184800 Sobic007G184800 Sobic004G259300--Sobic007G184800 Sobic003G005100 Sobic003G005100 Sobic004G259300--Sobic003G005100 Sobic004G259300--Sobic007G077532 Sobic004G259300--Sobic007G177500 Sobic004G259300--Sobic008G006000 Sobic007G177500--Sobic004G259300 Sobic007G177500--Sobic004G016100 Sobic004G116600 Sobic004G116600 Sobic007G177500--Sobic004G116600 Sobic007G177500--Sobic003G005100 Sobic007G177500--Sobic007G192400 Sobic007G177500--Sobic004G218300 Sobic007G177500--Sobic007G077532 Sobic001G281700 Sobic001G281700 Sobic007G177500--Sobic001G281700 Sobic006G130200 Sobic006G130200 Sobic007G177500--Sobic006G130200 Sobic004G141400--Sobic007G077532 Sobic004G141400--Sobic008G006000 Sobic004G141400--Sobic010G181600 Sobic004G141400--Sobic004G259300 Sobic004G141400--Sobic007G192400 Sobic001G356200 Sobic001G356200 Sobic004G141400--Sobic001G356200 Sobic004G141400--Sobic004G004100 Sobic004G141400--Sobic003G117800 Sobic004G141400--Sobic003G353700 Sobic005G170000--Sobic007G077532 Sobic005G170000--Sobic008G006000 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic005G170000--Sobic010G225201 Sobic005G170000--Sobic007G192400 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic005G170000--Sobic005G123400 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic005G170000--Sobic002G203600 Sobic005G170000--Sobic004G016100 Sobic010G255900 Sobic010G255900 Sobic005G170000--Sobic010G255900 Sobic005G170000--Sobic004G141400 Sobic007G192400--Sobic003G353700 Sobic007G192400--Sobic008G006000 Sobic007G192400--Sobic007G077532 Sobic007G192400--Sobic010G181600 Sobic009G252300 Sobic009G252300 Sobic007G192400--Sobic009G252300 Sobic007G192400--Sobic004G259300 Sobic007G192400--Sobic002G203600 Sobic008G036600 Sobic008G036600 Sobic007G192400--Sobic008G036600 Sobic007G192400--Sobic004G141400 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic003G402900--Sobic007G030100 Sobic003G368400 Sobic003G368400 Sobic003G402900--Sobic003G368400 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic003G402900--Sobic001G385000 Sobic004G017900 Sobic004G017900 Sobic003G402900--Sobic004G017900 Sobic007G189100 Sobic007G189100 Sobic003G402900--Sobic007G189100 Sobic002G147100 Sobic002G147100 Sobic003G402900--Sobic002G147100 Sobic006G215100 Sobic006G215100 Sobic003G402900--Sobic006G215100 Sobic002G147200 Sobic002G147200 Sobic003G402900--Sobic002G147200 Sobic007G043700 Sobic007G043700 Sobic003G402900--Sobic007G043700 Sobic005G030700 Sobic005G030700 Sobic009G228400--Sobic005G030700 Sobic009G228400--Sobic004G218300 Sobic009G228400--Sobic002G147100 Sobic004G111600 Sobic004G111600 Sobic009G228400--Sobic004G111600 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic009G228400--Sobic010G035801 Sobic007G147400 Sobic007G147400 Sobic009G228400--Sobic007G147400 Sobic009G228400--Sobic007G192400 Sobic009G228400--Sobic006G130200 Sobic009G228400--Sobic002G203600 Sobic003G398400 Sobic003G398400 Sobic004G218300--Sobic003G398400 Sobic004G218300--Sobic006G130200 Sobic004G218300--Sobic004G259300 Sobic004G218300--Sobic009G228400 Sobic004G218300--Sobic006G215100 Sobic003G407100 Sobic003G407100 Sobic004G218300--Sobic003G407100 Sobic004G218300--Sobic007G192400 Sobic004G218300--Sobic002G147100 Sobic002G317400 Sobic002G317400 Sobic004G218300--Sobic002G317400
Octagon: transcription factors


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