Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G102000.3,Sobic.009G102000.1,Sobic.009G102000.2
Synonym Sb09g016200
Functional annotation OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P7Z7
Pfam PF02892
Panther DB PTHR31264:SF4 PTHR31264 PTHR31264 PTHR31264:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G42170 : BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g32640.1 : OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G149800 histone acetyltransferase HAC5, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
2 Sobic.002G317400 expressed protein -
3 Sobic.009G040800 helicase, putative, expressed K10844: ERCC2, DNA excision repair protein ERCC-2
4 Sobic.004G122900 gamma-secretase subunit APH-1B, putative, expressed -
5 Sobic.002G147100 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed -
6 Sobic.002G063900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G129600 ABTB1 - Armadillo repeats with a Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed -
8 Sobic.007G147400 - -
9 Sobic.003G299500 expressed protein -
10 Sobic.001G424600 digalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K09480: digalactosyldiacylglycerol synthase
11 Sobic.002G235900 phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G124600 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
13 Sobic.010G237650 - -
14 Sobic.006G170900 growth regulator related protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G521700 - -
16 Sobic.004G106250 - -
17 Sobic.005G154500 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G260650 - -
19 Sobic.002G263300 - -
20 Sobic.002G033600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic009G102000--Sobic008G149800 Sobic002G317400 Sobic002G317400 Sobic009G102000--Sobic002G317400 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic009G102000--Sobic009G040800 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic009G102000--Sobic004G122900 Sobic002G147100 Sobic002G147100 Sobic009G102000--Sobic002G147100 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic009G102000--Sobic002G063900 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic009G102000--Sobic009G129600 Sobic007G147400 Sobic007G147400 Sobic009G102000--Sobic007G147400 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic009G102000--Sobic003G299500 Sobic006G116100 Sobic006G116100 Sobic008G149800--Sobic006G116100 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic008G149800--Sobic008G153000 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic008G149800--Sobic007G061700 Sobic002G357700 Sobic002G357700 Sobic008G149800--Sobic002G357700 Sobic002G164300 Sobic002G164300 Sobic008G149800--Sobic002G164300 Sobic004G246100 Sobic004G246100 Sobic008G149800--Sobic004G246100 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic008G149800--Sobic002G158700 Sobic005G154500 Sobic005G154500 Sobic008G149800--Sobic005G154500 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic008G149800--Sobic001G155000 Sobic002G317400--Sobic007G147400 Sobic002G317400--Sobic008G149800 SobicK028600 SobicK028600 Sobic002G317400--SobicK028600 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic002G317400--Sobic002G103600 Sobic002G317400--Sobic009G102000 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic002G317400--Sobic003G444800 Sobic002G317400--Sobic002G063900 Sobic002G278000 Sobic002G278000 Sobic002G317400--Sobic002G278000 Sobic003G039900 Sobic003G039900 Sobic002G317400--Sobic003G039900 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic009G040800--Sobic010G278600 Sobic006G091000 Sobic006G091000 Sobic009G040800--Sobic006G091000 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic009G040800--Sobic005G040900 Sobic009G040800--Sobic009G129600 Sobic001G335900 Sobic001G335900 Sobic009G040800--Sobic001G335900 Sobic009G040800--Sobic008G149800 Sobic009G040800--Sobic004G246100 Sobic001G042200 Sobic001G042200 Sobic009G040800--Sobic001G042200 Sobic004G353400 Sobic004G353400 Sobic009G040800--Sobic004G353400 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic004G122900--Sobic003G181700 Sobic009G122500 Sobic009G122500 Sobic004G122900--Sobic009G122500 Sobic009G194000 Sobic009G194000 Sobic004G122900--Sobic009G194000 Sobic001G156900 Sobic001G156900 Sobic004G122900--Sobic001G156900 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic004G122900--Sobic001G043200 Sobic001G335000 Sobic001G335000 Sobic004G122900--Sobic001G335000 Sobic001G308400 Sobic001G308400 Sobic004G122900--Sobic001G308400 Sobic003G021600 Sobic003G021600 Sobic004G122900--Sobic003G021600 Sobic002G227500 Sobic002G227500 Sobic004G122900--Sobic002G227500 Sobic002G147200 Sobic002G147200 Sobic002G147100--Sobic002G147200 Sobic002G147100--Sobic007G147400 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic002G147100--Sobic007G030100 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic002G147100--Sobic009G228400 Sobic004G042900 Sobic004G042900 Sobic002G147100--Sobic004G042900 Sobic002G147100--Sobic009G102000 Sobic006G165800 Sobic006G165800 Sobic002G147100--Sobic006G165800 Sobic003G398400 Sobic003G398400 Sobic002G147100--Sobic003G398400 Sobic002G147100--Sobic002G317400 Sobic008G173100 Sobic008G173100 Sobic002G063900--Sobic008G173100 Sobic002G063900--Sobic006G116100 Sobic004G357100 Sobic004G357100 Sobic002G063900--Sobic004G357100 Sobic002G260400 Sobic002G260400 Sobic002G063900--Sobic002G260400 Sobic007G090430 Sobic007G090430 Sobic002G063900--Sobic007G090430 Sobic002G063900--Sobic004G246100 Sobic002G063900--Sobic002G278000 Sobic002G063900--Sobic008G149800 Sobic002G063900--SobicK028600 Sobic008G058800 Sobic008G058800 Sobic009G129600--Sobic008G058800 Sobic010G077500 Sobic010G077500 Sobic009G129600--Sobic010G077500 Sobic001G346700 Sobic001G346700 Sobic009G129600--Sobic001G346700 Sobic006G248500 Sobic006G248500 Sobic009G129600--Sobic006G248500 Sobic009G129600--Sobic009G040800 Sobic009G129600--Sobic002G063900 Sobic008G100100 Sobic008G100100 Sobic009G129600--Sobic008G100100 Sobic002G357100 Sobic002G357100 Sobic009G129600--Sobic002G357100 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G129600--Sobic002G148400 Sobic007G147400--SobicK028600 Sobic007G147400--Sobic002G063900 Sobic007G147400--Sobic002G317400 Sobic007G147400--Sobic003G444800 Sobic001G376200 Sobic001G376200 Sobic007G147400--Sobic001G376200 Sobic007G147400--Sobic002G147100 Sobic007G147400--Sobic002G103600 Sobic007G147400--Sobic003G039900 Sobic007G147400--Sobic002G357700 Sobic007G034200 Sobic007G034200 Sobic003G299500--Sobic007G034200 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic003G299500--Sobic003G194800 Sobic004G106250 Sobic004G106250 Sobic003G299500--Sobic004G106250 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G299500--Sobic009G120400 Sobic003G016500 Sobic003G016500 Sobic003G299500--Sobic003G016500 Sobic001G123600 Sobic001G123600 Sobic003G299500--Sobic001G123600 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic003G299500--Sobic006G245900 Sobic002G235900 Sobic002G235900 Sobic003G299500--Sobic002G235900 Sobic006G191200 Sobic006G191200 Sobic003G299500--Sobic006G191200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.