Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G263300.3,Sobic.002G263300.1,Sobic.002G263300.4
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5X5C6 , A0A1B6QDL4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G102000 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G292800 MORN repeat domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G006500 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.005G163100 dnaJ domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G135300 FAR1 family protein, expressed -
6 Sobic.002G060600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G194000 expressed protein -
8 Sobic.009G260650 - -
9 Sobic.002G317400 expressed protein -
10 Sobic.004G007900 SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed K11643: CHD4, chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
11 Sobic.003G070100 expressed protein -
12 Sobic.010G033600 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed K10803: DNA-repair protein XRCC1
13 Sobic.002G063900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G079100 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
15 Sobic.008G097600 cyclin-T1-4, putative, expressed K15188: cyclin T
16 Sobic.007G094500 KH domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G165800 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
18 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
19 Sobic.001G495400 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G147400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G263300 Sobic002G263300 Sobic009G102000 Sobic009G102000 Sobic002G263300--Sobic009G102000 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic002G263300--Sobic002G292800 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic002G263300--Sobic006G006500 Sobic005G163100 Sobic005G163100 Sobic002G263300--Sobic005G163100 Sobic009G135300 Sobic009G135300 Sobic002G263300--Sobic009G135300 Sobic002G060600 Sobic002G060600 Sobic002G263300--Sobic002G060600 Sobic004G194000 Sobic004G194000 Sobic002G263300--Sobic004G194000 Sobic009G260650 Sobic009G260650 Sobic002G263300--Sobic009G260650 Sobic002G317400 Sobic002G317400 Sobic002G263300--Sobic002G317400 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic009G102000--Sobic008G149800 Sobic009G102000--Sobic002G317400 Sobic009G040800 Sobic009G040800 Sobic009G102000--Sobic009G040800 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic009G102000--Sobic004G122900 Sobic002G147100 Sobic002G147100 Sobic009G102000--Sobic002G147100 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic009G102000--Sobic002G063900 Sobic009G129600 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Octagon: transcription factors


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