Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G135300.6,Sobic.009G135300.2,Sobic.009G135300.12,Sobic.009G135300.7,Sobic.009G135300.1,Sobic.009G135300.3,Sobic.009G135300.5,Sobic.009G135300.4,Sobic.009G135300.8,Sobic.009G135300.13,Sobic.009G135300.11,Sobic.009G135300.10,Sobic.009G135300.14,Sobic.009G135300.9
Synonym FAR1, Sb09g020125
Functional annotation FAR1 family protein, expressed
UniProt A0A1Z5R3I0 , A0A1Z5R2K3 , A0A1Z5R2J3 , A0A1B6P8A2 , A0A1Z5R2K5 , A0A1B6P8C9 , A0A1Z5R3Q0 , A0A1Z5R2K8 , A0A1Z5R3H5 , A0A1Z5R2N8 , A0A1B6P8B0 , A0A1B6P8A5
Pfam PF03101
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF31 PTHR12606:SF31 PTHR12606
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18960 : FAR1-related sequence 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17290.3,LOC_Os11g19030.1 : expressed protein,FAR1 family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G263300 - -
2 Sobic.004G007900 SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed K11643: CHD4, chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
3 Sobic.004G194000 expressed protein -
4 Sobic.009G102000 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G224100 expressed protein -
6 Sobic.005G163100 dnaJ domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G317400 expressed protein -
8 Sobic.006G006500 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.009G099100 rust-resistance protein Lr21, putative, expressed -
10 Sobic.002G235900 phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G116000 EDM2, putative, expressed -
12 Sobic.003G066700 OsFBX164 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G033600 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed K10803: DNA-repair protein XRCC1
14 Sobic.004G122900 gamma-secretase subunit APH-1B, putative, expressed -
15 Sobic.004G357100 expressed protein -
16 Sobic.008G080500 expressed protein -
17 Sobic.001G495400 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G097900 expressed protein -
19 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
20 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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