Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G340632.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A194YSW6
Pfam PF12937 PF14299
Panther DB PTHR32278 PTHR32278:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02230 : phloem protein 2-B1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g56840.1 : OsFBX70 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G025300 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
3 Sobic.008G143100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G051400 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
5 Sobic.005G170000 expressed protein -
6 Sobic.002G220600 potassium transporter, putative, expressed -
7 Sobic.005G191700 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13201: TIA1, nucleolysin TIA-1/TIAR
8 Sobic.002G342300 exostosin family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G123400 expressed protein -
10 Sobic.009G156100 - -
11 Sobic.008G116700 expressed protein -
12 Sobic.002G093300 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
13 Sobic.003G039900 OsFBDUF1 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G318000 expressed protein -
15 Sobic.003G010900 expressed protein -
16 Sobic.010G152600 - -
17 Sobic.009G228000 ubiquitin-conjugating enzyme domain containing protein, expressed K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
18 Sobic.009G140900 expressed protein -
19 Sobic.001G114200 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
20 Sobic.007G218600 phosphoribosyl transferase, putative, expressed K00761: upp, uracil phosphoribosyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G340632 Sobic004G340632 Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic004G340632--Sobic003G377500 Sobic005G025300 Sobic005G025300 Sobic004G340632--Sobic005G025300 Sobic008G143100 Sobic008G143100 Sobic004G340632--Sobic008G143100 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic004G340632--Sobic001G051400 Sobic005G170000 Sobic005G170000 Sobic004G340632--Sobic005G170000 Sobic002G220600 Sobic002G220600 Sobic004G340632--Sobic002G220600 Sobic005G191700 Sobic005G191700 Sobic004G340632--Sobic005G191700 Sobic002G342300 Sobic002G342300 Sobic004G340632--Sobic002G342300 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic004G340632--Sobic005G123400 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic003G377500--Sobic009G156100 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic003G377500--Sobic001G114200 Sobic006G005200 Sobic006G005200 Sobic003G377500--Sobic006G005200 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic003G377500--Sobic008G116700 Sobic003G405600 Sobic003G405600 Sobic003G377500--Sobic003G405600 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic003G377500--Sobic002G200000 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic003G377500--Sobic003G402800 Sobic005G090200 Sobic005G090200 Sobic003G377500--Sobic005G090200 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic003G377500--Sobic008G055500 Sobic001G043400 Sobic001G043400 Sobic005G025300--Sobic001G043400 Sobic001G294100 Sobic001G294100 Sobic005G025300--Sobic001G294100 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic005G025300--Sobic010G278600 Sobic001G373400 Sobic001G373400 Sobic005G025300--Sobic001G373400 Sobic010G055800 Sobic010G055800 Sobic005G025300--Sobic010G055800 Sobic002G227200 Sobic002G227200 Sobic005G025300--Sobic002G227200 Sobic003G368800 Sobic003G368800 Sobic005G025300--Sobic003G368800 Sobic004G236800 Sobic004G236800 Sobic005G025300--Sobic004G236800 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic005G025300--Sobic006G078600 Sobic004G081900 Sobic004G081900 Sobic008G143100--Sobic004G081900 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic008G143100--Sobic006G162400 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic008G143100--Sobic001G453600 Sobic007G049900 Sobic007G049900 Sobic008G143100--Sobic007G049900 Sobic008G124600 Sobic008G124600 Sobic008G143100--Sobic008G124600 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G143100--Sobic003G428000 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic008G143100--Sobic002G392400 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic008G143100--Sobic002G414800 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic008G143100--Sobic006G119900 Sobic002G066800 Sobic002G066800 Sobic001G051400--Sobic002G066800 Sobic007G034200 Sobic007G034200 Sobic001G051400--Sobic007G034200 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic001G051400--Sobic003G393200 Sobic003G010900 Sobic003G010900 Sobic001G051400--Sobic003G010900 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic001G051400--Sobic009G120400 Sobic006G191200 Sobic006G191200 Sobic001G051400--Sobic006G191200 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic001G051400--Sobic005G087300 Sobic002G078100 Sobic002G078100 Sobic001G051400--Sobic002G078100 Sobic001G051400--Sobic005G123400 Sobic007G077532 Sobic007G077532 Sobic005G170000--Sobic007G077532 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic005G170000--Sobic008G006000 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic005G170000--Sobic010G225201 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic005G170000--Sobic007G192400 Sobic005G170000--Sobic005G123400 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic005G170000--Sobic002G203600 Sobic004G016100 Sobic004G016100 Sobic005G170000--Sobic004G016100 Sobic010G255900 Sobic010G255900 Sobic005G170000--Sobic010G255900 Sobic004G141400 Sobic004G141400 Sobic005G170000--Sobic004G141400 Sobic002G220600--Sobic004G340632 Sobic004G031100 Sobic004G031100 Sobic002G220600--Sobic004G031100 Sobic002G220600--Sobic006G005200 Sobic003G436000 Sobic003G436000 Sobic002G220600--Sobic003G436000 Sobic004G031200 Sobic004G031200 Sobic002G220600--Sobic004G031200 Sobic002G220600--Sobic003G377500 Sobic004G130932 Sobic004G130932 Sobic002G220600--Sobic004G130932 Sobic002G220600--Sobic008G116700 Sobic005G132600 Sobic005G132600 Sobic002G220600--Sobic005G132600 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic005G191700--Sobic006G269800 Sobic005G046900 Sobic005G046900 Sobic005G191700--Sobic005G046900 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic005G191700--Sobic002G145800 Sobic001G013300 Sobic001G013300 Sobic005G191700--Sobic001G013300 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic005G191700--Sobic003G409200 Sobic008G057000 Sobic008G057000 Sobic005G191700--Sobic008G057000 Sobic003G062300 Sobic003G062300 Sobic005G191700--Sobic003G062300 Sobic005G191700--Sobic001G373400 Sobic002G029100 Sobic002G029100 Sobic005G191700--Sobic002G029100 Sobic002G342300--Sobic005G123400 Sobic006G237500 Sobic006G237500 Sobic002G342300--Sobic006G237500 Sobic003G432800 Sobic003G432800 Sobic002G342300--Sobic003G432800 Sobic005G216800 Sobic005G216800 Sobic002G342300--Sobic005G216800 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic002G342300--Sobic001G043200 Sobic003G113300 Sobic003G113300 Sobic002G342300--Sobic003G113300 Sobic006G112500 Sobic006G112500 Sobic002G342300--Sobic006G112500 Sobic002G342300--Sobic001G051400 Sobic002G342300--Sobic003G393200 Sobic005G123400--Sobic006G237500 Sobic010G112600 Sobic010G112600 Sobic005G123400--Sobic010G112600 Sobic005G123400--Sobic003G393200 Sobic005G123400--Sobic001G043200 Sobic009G227100 Sobic009G227100 Sobic005G123400--Sobic009G227100 Sobic009G252300 Sobic009G252300 Sobic005G123400--Sobic009G252300 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic005G123400--Sobic007G030100 Sobic003G190200 Sobic003G190200 Sobic005G123400--Sobic003G190200 Sobic003G368400 Sobic003G368400 Sobic005G123400--Sobic003G368400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.