Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G140900.1,Sobic.009G140900.2
Synonym Sb09g020630
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YY55 , A0A1Z5R2M2
Pfam -
Panther DB PTHR34201 PTHR34201:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10330 : glycine-rich protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G140900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G032400 - -
2 Sobic.006G158332 - -
3 Sobic.001G464400 expressed protein -
4 Sobic.006G203600 EF hand family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G095000 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
6 Sobic.001G025700 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
7 Sobic.008G111800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
8 Sobic.007G032000 tryptophan synthase beta chain 1, putative, expressed K01696: tryptophan synthase beta chain
9 Sobic.010G225201 - -
10 Sobic.003G202600 single myb histone, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
11 Sobic.009G156100 - -
12 Sobic.008G116700 expressed protein -
13 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G111700 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
15 Sobic.002G200000 zinc finger, C3HC4 type, putative, expressed -
16 Sobic.006G041800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
17 Sobic.001G485300 transcription initiation factor IIE subunit beta, putative, expressed K03137: TFIIE2, GTF2E2, transcription initiation factor TFIIE subunit beta
18 Sobic.004G340632 - -
19 Sobic.008G013200 expressed protein -
20 Sobic.010G069500 zinc ion binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G140900 Sobic009G140900 Sobic003G032400 Sobic003G032400 Sobic009G140900--Sobic003G032400 Sobic006G158332 Sobic006G158332 Sobic009G140900--Sobic006G158332 Sobic001G464400 Sobic001G464400 Sobic009G140900--Sobic001G464400 Sobic006G203600 Sobic006G203600 Sobic009G140900--Sobic006G203600 Sobic001G095000 Sobic001G095000 Sobic009G140900--Sobic001G095000 Sobic001G025700 Sobic001G025700 Sobic009G140900--Sobic001G025700 Sobic008G111800 Sobic008G111800 Sobic009G140900--Sobic008G111800 Sobic007G032000 Sobic007G032000 Sobic009G140900--Sobic007G032000 Sobic010G225201 Sobic010G225201 Sobic009G140900--Sobic010G225201 Sobic003G032400--Sobic001G095000 Sobic003G202600 Sobic003G202600 Sobic003G032400--Sobic003G202600 Sobic010G071100 Sobic010G071100 Sobic003G032400--Sobic010G071100 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic003G032400--Sobic007G076400 Sobic003G032400--Sobic009G140900 Sobic001G237600 Sobic001G237600 Sobic003G032400--Sobic001G237600 Sobic004G054700 Sobic004G054700 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Octagon: transcription factors


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