Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G143250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RB00
Pfam PF00538
Panther DB PTHR11467 PTHR11467:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006334; nucleosome assembly GO:0005634nucleus GO:0003677DNA binding GO:0000786nucleosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14900 : high mobility group A
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g33190.1 : linker histone H1 and H5 family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031100 , Zm00025a005985
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G237650 - -
2 Sobic.007G077532 - K08597: SENP8, NEDP1, sentrin-specific protease 8
3 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144
4 Sobic.007G184800 transcription factor RF2a, putative, expressed -
5 Sobic.003G289100 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
7 Sobic.001G521700 - -
8 Sobic.007G157500 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
9 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
10 Sobic.007G192400 zinc ion binding protein, putative, expressed K15196: BRF1, transcription factor IIIB 90 kDa subunit
11 Sobic.006G048300 - -
12 Sobic.005G170000 expressed protein -
13 Sobic.004G141400 START domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G057400 expressed protein -
15 Sobic.004G259300 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type domain containing protein, expressed K15687: E3 ubiquitin-protein ligase makorin
16 Sobic.005G123400 expressed protein -
17 Sobic.007G221500 expressed protein -
18 Sobic.003G092066 - -
19 Sobic.003G402900 HYS1, putative, expressed -
20 Sobic.002G033600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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