Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G011800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P633
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.009G011800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G171400 - -
2 Sobic.002G347800 expressed protein -
3 Sobic.004G087200 flavonol-3-O-glycoside-7-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
4 Sobic.003G265701 - -
5 Sobic.009G183000 - -
6 Sobic.003G137900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.009G099050 - -
8 Sobic.001G256600 GRF zinc finger family protein, expressed -
9 Sobic.003G351150 - -
10 Sobic.002G079801 - -
11 Sobic.001G075950 - -
12 Sobic.010G260300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.009G022500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@white-brown complex homolog protein 16, putative, expressed -
14 Sobic.003G272400 DUF292 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G120200 expressed protein -
16 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G064700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
18 Sobic.005G060600 - -
19 Sobic.008G040900 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
20 Sobic.003G181201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G011800 Sobic009G011800 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic009G011800--Sobic002G171400 Sobic002G347800 Sobic002G347800 Sobic009G011800--Sobic002G347800 Sobic004G087200 Sobic004G087200 Sobic009G011800--Sobic004G087200 Sobic003G265701 Sobic003G265701 Sobic009G011800--Sobic003G265701 Sobic009G183000 Sobic009G183000 Sobic009G011800--Sobic009G183000 Sobic003G137900 Sobic003G137900 Sobic009G011800--Sobic003G137900 Sobic009G099050 Sobic009G099050 Sobic009G011800--Sobic009G099050 Sobic001G256600 Sobic001G256600 Sobic009G011800--Sobic001G256600 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic009G011800--Sobic003G351150 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic002G171400--Sobic008G065400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic002G171400--Sobic005G043100 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G171400--Sobic003G429500 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic002G171400--Sobic001G278600 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G171400--Sobic002G431200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 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Octagon: transcription factors


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