Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G014500.3,Sobic.009G014500.2,Sobic.009G014500.4
Synonym emb2735, Sb09g001410
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YYK1
Pfam -
Panther DB PTHR36064
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06240 : embryo defective 2735
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g02190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040929
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G074500 shugoshin-1, putative, expressed -
2 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin
3 Sobic.001G088000 expressed protein -
4 Sobic.002G095800 expressed protein -
5 Sobic.003G025100 PSF2 - Putative GINS complex subunit, expressed K10733: GINS2, GINS complex subunit 2
6 Sobic.003G384100 ZIP4/SPO22, putative, expressed -
7 Sobic.009G042500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.001G221601 - -
9 Sobic.009G166650 - -
10 Sobic.010G158832 - -
11 Sobic.004G202900 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G195100 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K17496: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50
13 Sobic.006G137300 methyladenine glycosylase, putative, expressed K01246: DNA-3-methyladenine glycosylase I
14 Sobic.009G165600 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, putative, expressed K03017: RPB9, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
15 Sobic.003G063500 expressed protein -
16 Sobic.001G141200 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07943: ADP-ribosylation factor-like protein 2
17 Sobic.001G001700 - -
18 Sobic.003G125332 - K19347: SUN domain-containing protein 1/2
19 Sobic.004G348700 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G239800 expressed protein K19307: 25S rRNA (uracil2634-N3)-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G014500 Sobic009G014500 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic009G014500--Sobic002G074500 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic009G014500--Sobic002G390700 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic009G014500--Sobic001G088000 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic009G014500--Sobic002G095800 Sobic003G025100 Sobic003G025100 Sobic009G014500--Sobic003G025100 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic009G014500--Sobic003G384100 Sobic009G042500 Sobic009G042500 Sobic009G014500--Sobic009G042500 Sobic001G221601 Sobic001G221601 Sobic009G014500--Sobic001G221601 Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic009G014500--Sobic009G166650 Sobic002G074500--Sobic003G384100 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic002G074500--Sobic002G239800 Sobic002G074500--Sobic009G014500 Sobic002G074500--Sobic002G390700 Sobic001G497800 Sobic001G497800 Sobic002G074500--Sobic001G497800 Sobic006G087800 Sobic006G087800 Sobic002G074500--Sobic006G087800 Sobic001G538275 Sobic001G538275 Sobic002G074500--Sobic001G538275 Sobic002G074500--Sobic002G095800 Sobic001G001700 Sobic001G001700 Sobic002G074500--Sobic001G001700 Sobic010G078400 Sobic010G078400 Sobic002G390700--Sobic010G078400 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic002G390700--Sobic001G303300 Sobic002G390700--Sobic001G221601 Sobic002G390700--Sobic002G074500 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic002G390700--Sobic003G106800 Sobic003G092000 Sobic003G092000 Sobic002G390700--Sobic003G092000 Sobic002G390700--Sobic009G166650 Sobic002G390700--Sobic009G014500 Sobic002G390700--Sobic002G239800 Sobic005G164900 Sobic005G164900 Sobic001G088000--Sobic005G164900 Sobic006G031400 Sobic006G031400 Sobic001G088000--Sobic006G031400 Sobic002G113600 Sobic002G113600 Sobic001G088000--Sobic002G113600 Sobic001G088000--Sobic002G074500 Sobic001G296000 Sobic001G296000 Sobic001G088000--Sobic001G296000 Sobic001G088000--Sobic003G092000 Sobic001G088000--Sobic010G078400 Sobic006G137300 Sobic006G137300 Sobic001G088000--Sobic006G137300 Sobic001G088000--Sobic001G221601 Sobic002G095800--Sobic003G384100 Sobic002G095800--Sobic009G166650 Sobic002G095800--Sobic002G074500 Sobic002G095800--Sobic002G390700 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic002G095800--Sobic007G172900 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic002G095800--Sobic006G234500 Sobic002G095200 Sobic002G095200 Sobic002G095800--Sobic002G095200 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic002G095800--Sobic010G046200 Sobic002G095800--Sobic001G303300 Sobic002G246900 Sobic002G246900 Sobic003G025100--Sobic002G246900 Sobic004G047100 Sobic004G047100 Sobic003G025100--Sobic004G047100 Sobic001G192700 Sobic001G192700 Sobic003G025100--Sobic001G192700 Sobic003G008700 Sobic003G008700 Sobic003G025100--Sobic003G008700 Sobic004G032900 Sobic004G032900 Sobic003G025100--Sobic004G032900 Sobic001G521100 Sobic001G521100 Sobic003G025100--Sobic001G521100 Sobic009G189200 Sobic009G189200 Sobic003G025100--Sobic009G189200 Sobic002G426800 Sobic002G426800 Sobic003G025100--Sobic002G426800 Sobic009G131200 Sobic009G131200 Sobic003G025100--Sobic009G131200 Sobic003G384100--Sobic002G074500 Sobic010G237200 Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic010G237200 Sobic003G063500 Sobic003G063500 Sobic003G384100--Sobic003G063500 Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic007G143900 Sobic003G384100--Sobic002G239800 Sobic003G384100--Sobic002G095800 Sobic003G384100--Sobic007G172900 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic003G384100--Sobic004G041000 Sobic003G384100--Sobic010G046200 Sobic003G202700 Sobic003G202700 Sobic009G042500--Sobic003G202700 Sobic001G200600 Sobic001G200600 Sobic009G042500--Sobic001G200600 Sobic003G433600 Sobic003G433600 Sobic009G042500--Sobic003G433600 Sobic006G266000 Sobic006G266000 Sobic009G042500--Sobic006G266000 Sobic001G226200 Sobic001G226200 Sobic009G042500--Sobic001G226200 Sobic010G067000 Sobic010G067000 Sobic009G042500--Sobic010G067000 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic009G042500--Sobic004G250100 Sobic010G066900 Sobic010G066900 Sobic009G042500--Sobic010G066900 Sobic002G292400 Sobic002G292400 Sobic009G042500--Sobic002G292400 Sobic004G312400 Sobic004G312400 Sobic001G221601--Sobic004G312400 Sobic001G221601--Sobic002G390700 Sobic004G064700 Sobic004G064700 Sobic001G221601--Sobic004G064700 Sobic001G221601--Sobic009G166650 Sobic004G073800 Sobic004G073800 Sobic001G221601--Sobic004G073800 Sobic003G107000 Sobic003G107000 Sobic001G221601--Sobic003G107000 Sobic010G213000 Sobic010G213000 Sobic001G221601--Sobic010G213000 Sobic001G088400 Sobic001G088400 Sobic001G221601--Sobic001G088400 Sobic001G221601--Sobic001G088000 Sobic009G166400 Sobic009G166400 Sobic009G166650--Sobic009G166400 Sobic009G166650--Sobic002G095800 Sobic002G305900 Sobic002G305900 Sobic009G166650--Sobic002G305900 Sobic001G455300 Sobic001G455300 Sobic009G166650--Sobic001G455300 Sobic009G166650--Sobic002G390700 Sobic009G166650--Sobic001G221601 Sobic007G102600 Sobic007G102600 Sobic009G166650--Sobic007G102600 Sobic001G394000 Sobic001G394000 Sobic009G166650--Sobic001G394000 Sobic009G166650--Sobic004G073800
Octagon: transcription factors


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