Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G132200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8W1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110547 - -
2 Sobic.005G115350 - -
3 Sobic.010G165700 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
4 Sobic.003G017000 - -
5 Sobic.008G018700 expressed protein -
6 Sobic.002G053500 - -
7 Sobic.007G180050 - -
8 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
9 Sobic.001G318100 - -
10 Sobic.001G085450 - -
11 Sobic.004G056800 DEFL1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.005G076800 OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G421000 - -
14 Sobic.002G285001 - -
15 Sobic.005G102350 - -
16 Sobic.002G381100 expressed protein -
17 Sobic.004G138450 - -
18 Sobic.002G397650 - -
19 Sobic.003G163301 - -
20 Sobic.002G240400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G132200 Sobic009G132200 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic009G132200--Sobic005G110547 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic009G132200--Sobic005G115350 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic009G132200--Sobic010G165700 Sobic003G017000 Sobic003G017000 Sobic009G132200--Sobic003G017000 Sobic008G018700 Sobic008G018700 Sobic009G132200--Sobic008G018700 Sobic002G053500 Sobic002G053500 Sobic009G132200--Sobic002G053500 Sobic007G180050 Sobic007G180050 Sobic009G132200--Sobic007G180050 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic009G132200--Sobic004G213400 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G132200--Sobic001G318100 Sobic005G110547--Sobic004G213400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic002G239400 Sobic005G110547--Sobic005G115350 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic001G440000 Sobic005G110547--Sobic002G053500 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G110547--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G110547--Sobic009G070250 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G165700 Sobic005G115350--Sobic005G110547 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic005G115350--Sobic002G101100 Sobic002G240500 Sobic002G240500 Sobic005G115350--Sobic002G240500 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic005G115350--Sobic010G165800 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic005G115350--Sobic004G291200 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic005G115350--Sobic005G102350 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic010G257500 Sobic005G115350--Sobic009G070250 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic005G115350--Sobic009G178500 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic010G165800 Sobic002G397650 Sobic002G397650 Sobic003G017000--Sobic002G397650 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic003G017000--Sobic006G109600 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic003G017000--Sobic002G175700 Sobic005G055501 Sobic005G055501 Sobic003G017000--Sobic005G055501 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic003G017000--Sobic007G090439 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic003G017000--Sobic005G031901 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic003G017000--Sobic003G126750 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic003G017000--Sobic010G147300 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic003G017000--Sobic001G261464 Sobic004G056800 Sobic004G056800 Sobic008G018700--Sobic004G056800 Sobic010G109800 Sobic010G109800 Sobic008G018700--Sobic010G109800 Sobic003G421000 Sobic003G421000 Sobic008G018700--Sobic003G421000 Sobic002G095600 Sobic002G095600 Sobic008G018700--Sobic002G095600 Sobic007G226500 Sobic007G226500 Sobic008G018700--Sobic007G226500 Sobic006G079800 Sobic006G079800 Sobic008G018700--Sobic006G079800 Sobic001G067700 Sobic001G067700 Sobic008G018700--Sobic001G067700 Sobic001G257200 Sobic001G257200 Sobic008G018700--Sobic001G257200 Sobic001G307500 Sobic001G307500 Sobic008G018700--Sobic001G307500 Sobic002G053500--Sobic005G110547 Sobic002G053500--Sobic004G213400 Sobic002G053500--Sobic005G115350 Sobic008G143100 Sobic008G143100 Sobic002G053500--Sobic008G143100 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic002G053500--Sobic002G392400 Sobic002G053500--Sobic002G239400 Sobic010G222732 Sobic010G222732 Sobic002G053500--Sobic010G222732 Sobic002G193500 Sobic002G193500 Sobic002G053500--Sobic002G193500 Sobic004G081900 Sobic004G081900 Sobic002G053500--Sobic004G081900 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic007G180050--Sobic010G211200 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic007G180050--Sobic005G206100 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic007G180050--Sobic005G212201 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic007G180050--Sobic009G241900 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic007G180050--Sobic008G191700 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic007G180050--Sobic002G064800 Sobic003G427000 Sobic003G427000 Sobic007G180050--Sobic003G427000 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic007G180050--Sobic004G222150 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic007G180050--Sobic001G376501 Sobic004G213400--Sobic002G239400 Sobic004G213400--Sobic005G110547 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic004G213400--Sobic004G298600 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic004G213400--Sobic003G293400 Sobic001G248400 Sobic001G248400 Sobic004G213400--Sobic001G248400 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic004G213400--Sobic001G131900 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic004G213400--Sobic009G220700 Sobic002G308000 Sobic002G308000 Sobic004G213400--Sobic002G308000 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic004G213400--Sobic007G105700 Sobic001G318100--Sobic010G165700 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic002G101100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic010G165900 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic009G070250 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic001G318100--Sobic005G108225 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic001G318100--Sobic008G127250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.