Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G155600.1
Synonym Sb09g021900
Functional annotation 60S acidic ribosomal protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P8W9
Pfam PF00428
Panther DB PTHR21141
NCBI CDD KOG3449; 60S acidic ribosomal protein P2
KEGG Orthology K02943; RP-LP2, large subunit ribosomal protein LP2
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28500 : 60S acidic ribosomal protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g37330.1 : 60S acidic ribosomal protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037241
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G155600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G431300 uncharacterized ACR, YagE family COG1723 containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G155600 Sobic009G155600 Sobic003G260900 Sobic003G260900 Sobic009G155600--Sobic003G260900 Sobic006G067500 Sobic006G067500 Sobic009G155600--Sobic006G067500 Sobic008G095400 Sobic008G095400 Sobic009G155600--Sobic008G095400 Sobic001G513800 Sobic001G513800 Sobic009G155600--Sobic001G513800 Sobic001G025800 Sobic001G025800 Sobic009G155600--Sobic001G025800 Sobic007G208300 Sobic007G208300 Sobic009G155600--Sobic007G208300 Sobic004G064300 Sobic004G064300 Sobic009G155600--Sobic004G064300 Sobic001G033100 Sobic001G033100 Sobic009G155600--Sobic001G033100 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic009G155600--Sobic008G050400 Sobic003G260900--Sobic009G155600 Sobic003G260900--Sobic001G513800 Sobic002G121300 Sobic002G121300 Sobic003G260900--Sobic002G121300 Sobic008G021200 Sobic008G021200 Sobic003G260900--Sobic008G021200 Sobic003G260900--Sobic007G208300 Sobic003G260900--Sobic008G095400 Sobic003G260900--Sobic001G025800 Sobic005G117300 Sobic005G117300 Sobic003G260900--Sobic005G117300 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic003G260900--Sobic008G090900 Sobic001G168800 Sobic001G168800 Sobic006G067500--Sobic001G168800 Sobic003G412900 Sobic003G412900 Sobic006G067500--Sobic003G412900 Sobic008G188600 Sobic008G188600 Sobic006G067500--Sobic008G188600 Sobic006G067400 Sobic006G067400 Sobic006G067500--Sobic006G067400 Sobic009G059300 Sobic009G059300 Sobic006G067500--Sobic009G059300 Sobic003G371600 Sobic003G371600 Sobic006G067500--Sobic003G371600 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic006G067500--Sobic002G102200 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic006G067500--Sobic003G387100 Sobic006G050400 Sobic006G050400 Sobic006G067500--Sobic006G050400 Sobic008G095400--Sobic001G025800 Sobic008G095400--Sobic001G513800 Sobic003G162900 Sobic003G162900 Sobic008G095400--Sobic003G162900 Sobic008G095400--Sobic009G155600 Sobic007G090537 Sobic007G090537 Sobic008G095400--Sobic007G090537 Sobic002G221600 Sobic002G221600 Sobic008G095400--Sobic002G221600 Sobic006G054300 Sobic006G054300 Sobic008G095400--Sobic006G054300 Sobic010G204900 Sobic010G204900 Sobic008G095400--Sobic010G204900 Sobic010G095200 Sobic010G095200 Sobic008G095400--Sobic010G095200 Sobic001G495200 Sobic001G495200 Sobic001G513800--Sobic001G495200 Sobic001G513800--Sobic001G025800 Sobic001G513800--Sobic008G050400 Sobic005G143500 Sobic005G143500 Sobic001G513800--Sobic005G143500 Sobic001G513800--Sobic005G117300 Sobic002G048200 Sobic002G048200 Sobic001G513800--Sobic002G048200 Sobic004G336000 Sobic004G336000 Sobic001G513800--Sobic004G336000 Sobic001G513800--Sobic004G064300 Sobic004G065300 Sobic004G065300 Sobic001G513800--Sobic004G065300 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic001G025800--Sobic004G003900 Sobic001G025800--Sobic005G117300 Sobic001G025800--Sobic001G495200 Sobic001G025800--Sobic002G048200 Sobic009G251000 Sobic009G251000 Sobic001G025800--Sobic009G251000 Sobic001G025800--Sobic001G513800 Sobic003G267500 Sobic003G267500 Sobic001G025800--Sobic003G267500 Sobic007G015300 Sobic007G015300 Sobic001G025800--Sobic007G015300 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic001G025800--Sobic009G092900 Sobic001G531400 Sobic001G531400 Sobic007G208300--Sobic001G531400 Sobic001G291900 Sobic001G291900 Sobic007G208300--Sobic001G291900 Sobic003G085000 Sobic003G085000 Sobic007G208300--Sobic003G085000 Sobic007G208300--Sobic004G336000 Sobic004G301200 Sobic004G301200 Sobic007G208300--Sobic004G301200 Sobic001G295300 Sobic001G295300 Sobic007G208300--Sobic001G295300 Sobic001G104800 Sobic001G104800 Sobic007G208300--Sobic001G104800 Sobic006G132000 Sobic006G132000 Sobic007G208300--Sobic006G132000 Sobic004G055500 Sobic004G055500 Sobic007G208300--Sobic004G055500 Sobic004G064300--Sobic001G513800 Sobic004G064300--Sobic005G117300 Sobic004G064300--Sobic008G050400 Sobic004G064300--Sobic001G025800 Sobic004G064300--Sobic009G155600 Sobic002G304100 Sobic002G304100 Sobic004G064300--Sobic002G304100 Sobic004G064300--Sobic007G208300 Sobic004G064300--Sobic008G095400 Sobic004G064300--Sobic001G495200 Sobic003G022300 Sobic003G022300 Sobic001G033100--Sobic003G022300 Sobic009G210200 Sobic009G210200 Sobic001G033100--Sobic009G210200 Sobic008G015800 Sobic008G015800 Sobic001G033100--Sobic008G015800 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic001G033100--Sobic004G020300 Sobic001G222600 Sobic001G222600 Sobic001G033100--Sobic001G222600 Sobic006G084400 Sobic006G084400 Sobic001G033100--Sobic006G084400 Sobic001G033100--Sobic006G067400 Sobic002G200900 Sobic002G200900 Sobic001G033100--Sobic002G200900 Sobic008G064500 Sobic008G064500 Sobic001G033100--Sobic008G064500 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic008G050400--Sobic002G272100 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic008G050400--Sobic002G351600 Sobic008G050400--Sobic005G143500 Sobic002G274200 Sobic002G274200 Sobic008G050400--Sobic002G274200 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic008G050400--Sobic002G401800 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic008G050400--Sobic001G083100 Sobic008G050400--Sobic001G495200 Sobic003G232700 Sobic003G232700 Sobic008G050400--Sobic003G232700 Sobic002G406700 Sobic002G406700 Sobic008G050400--Sobic002G406700
Octagon: transcription factors


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