Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G513800.2,Sobic.001G513800.1
Synonym AKRP, Sb01g047950, EMB2036, EMB16
Functional annotation ankyrin repeat domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5SBF9
Pfam PF12796
Panther DB PTHR24198 PTHR24198:SF87
NCBI CDD KOG0512; Fetal globin-inducing factor (contains ankyrin repeats)
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66055 : ankyrin repeat protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g04300.1 : ankyrin repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000485 , Zm00025a052212
Brachypodium KQK23775 , PNT78252
Barley HORVU4Hr1G080940.8 , HORVU4Hr1G080940.2 , HORVU4Hr1G080940.1 , HORVU4Hr1G080940.7 , HORVU4Hr1G080940.5 , HORVU4Hr1G080940.4 , HORVU4Hr1G080940.3 , HORVU4Hr1G080940.6
Wheat TraesCS4B02G331800 , TraesCS4B02G331800 , TraesCS5A02G503200 , TraesCS5A02G503200 , TraesCS5A02G503200 , TraesCS4D02G328600
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cDNA sequences
Sobic.001G513800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G495200 Glutathione reductases(PubMedID : 23783412)@glutathione reductase, putative, expressed K00383: GSR, glutathione reductase (NADPH)
2 Sobic.001G025800 pentatricopeptide, putative, expressed -
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4 Sobic.005G143500 aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, putative, expressed K02434: gatB, aspartyl-tRNA(Asn)/glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B
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8 Sobic.004G064300 HD domain containing protein 2, putative, expressed K07023: putative hydrolases of HD superfamily
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12 Sobic.008G119300 - -
13 Sobic.008G095400 - -
14 Sobic.003G225100 uroporphyrinogen decarboxylase, putative, expressed K01599: hemE, uroporphyrinogen decarboxylase
15 Sobic.002G272100 expressed protein -
16 Sobic.002G424100 parvulin-type peptidyl prolyl cis/trans isomerase, putative, expressed -
17 Sobic.003G271900 expressed protein -
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19 Sobic.003G232700 peptide deformylase, putative, expressed K01462: PDF, peptide deformylase
20 Sobic.001G291900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G513800 Sobic001G513800 Sobic001G495200 Sobic001G495200 Sobic001G513800--Sobic001G495200 Sobic001G025800 Sobic001G025800 Sobic001G513800--Sobic001G025800 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic001G513800--Sobic008G050400 Sobic005G143500 Sobic005G143500 Sobic001G513800--Sobic005G143500 Sobic005G117300 Sobic005G117300 Sobic001G513800--Sobic005G117300 Sobic002G048200 Sobic002G048200 Sobic001G513800--Sobic002G048200 Sobic004G336000 Sobic004G336000 Sobic001G513800--Sobic004G336000 Sobic004G064300 Sobic004G064300 Sobic001G513800--Sobic004G064300 Sobic004G065300 Sobic004G065300 Sobic001G513800--Sobic004G065300 Sobic001G126300 Sobic001G126300 Sobic001G495200--Sobic001G126300 Sobic003G232700 Sobic003G232700 Sobic001G495200--Sobic003G232700 Sobic001G495200--Sobic004G336000 Sobic004G011300 Sobic004G011300 Sobic001G495200--Sobic004G011300 Sobic001G495200--Sobic005G143500 Sobic006G106400 Sobic006G106400 Sobic001G495200--Sobic006G106400 Sobic002G181000 Sobic002G181000 Sobic001G495200--Sobic002G181000 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic001G495200--Sobic005G110400 Sobic002G043600 Sobic002G043600 Sobic001G495200--Sobic002G043600 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic001G025800--Sobic004G003900 Sobic001G025800--Sobic005G117300 Sobic001G025800--Sobic001G495200 Sobic001G025800--Sobic002G048200 Sobic009G251000 Sobic009G251000 Sobic001G025800--Sobic009G251000 Sobic001G025800--Sobic001G513800 Sobic003G267500 Sobic003G267500 Sobic001G025800--Sobic003G267500 Sobic007G015300 Sobic007G015300 Sobic001G025800--Sobic007G015300 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic001G025800--Sobic009G092900 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic008G050400--Sobic002G272100 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic008G050400--Sobic002G351600 Sobic008G050400--Sobic005G143500 Sobic002G274200 Sobic002G274200 Sobic008G050400--Sobic002G274200 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic008G050400--Sobic002G401800 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic008G050400--Sobic001G083100 Sobic008G050400--Sobic001G495200 Sobic008G050400--Sobic003G232700 Sobic002G406700 Sobic002G406700 Sobic008G050400--Sobic002G406700 Sobic005G143500--Sobic005G110400 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic005G143500--Sobic008G039600 Sobic001G368500 Sobic001G368500 Sobic005G143500--Sobic001G368500 Sobic005G143500--Sobic002G401800 Sobic005G143500--Sobic006G106400 Sobic005G143500--Sobic002G272100 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic005G143500--Sobic008G073100 Sobic005G143500--Sobic001G495200 Sobic003G324700 Sobic003G324700 Sobic005G143500--Sobic003G324700 Sobic005G117300--Sobic004G003900 Sobic005G117300--Sobic009G092900 Sobic009G085200 Sobic009G085200 Sobic005G117300--Sobic009G085200 Sobic005G117300--Sobic001G025800 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic005G117300--Sobic008G090900 Sobic005G117300--Sobic004G065300 Sobic001G346600 Sobic001G346600 Sobic005G117300--Sobic001G346600 Sobic005G117300--Sobic001G495200 Sobic007G208300 Sobic007G208300 Sobic005G117300--Sobic007G208300 Sobic002G048200--Sobic001G495200 Sobic002G048200--Sobic005G143500 Sobic002G048200--Sobic001G126300 Sobic002G048200--Sobic001G025800 Sobic002G048200--Sobic002G181000 Sobic004G165000 Sobic004G165000 Sobic002G048200--Sobic004G165000 Sobic002G048200--Sobic004G065300 Sobic002G048200--Sobic003G232700 Sobic003G151500 Sobic003G151500 Sobic002G048200--Sobic003G151500 Sobic001G309300 Sobic001G309300 Sobic004G336000--Sobic001G309300 Sobic004G336000--Sobic001G495200 Sobic004G336000--Sobic008G073100 Sobic001G291900 Sobic001G291900 Sobic004G336000--Sobic001G291900 Sobic003G432500 Sobic003G432500 Sobic004G336000--Sobic003G432500 Sobic006G055800 Sobic006G055800 Sobic004G336000--Sobic006G055800 Sobic004G336000--Sobic004G011300 Sobic003G085000 Sobic003G085000 Sobic004G336000--Sobic003G085000 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic004G336000--Sobic003G387100 Sobic004G064300--Sobic001G513800 Sobic004G064300--Sobic005G117300 Sobic004G064300--Sobic008G050400 Sobic004G064300--Sobic001G025800 Sobic009G155600 Sobic009G155600 Sobic004G064300--Sobic009G155600 Sobic002G304100 Sobic002G304100 Sobic004G064300--Sobic002G304100 Sobic004G064300--Sobic007G208300 Sobic008G095400 Sobic008G095400 Sobic004G064300--Sobic008G095400 Sobic004G064300--Sobic001G495200 Sobic004G065300--Sobic001G368500 Sobic004G065300--Sobic006G055800 Sobic004G065300--Sobic003G432500 Sobic004G065300--Sobic005G110400 Sobic004G065300--Sobic003G324700 Sobic006G256600 Sobic006G256600 Sobic004G065300--Sobic006G256600 Sobic005G002900 Sobic005G002900 Sobic004G065300--Sobic005G002900 Sobic001G469933 Sobic001G469933 Sobic004G065300--Sobic001G469933 Sobic002G297400 Sobic002G297400 Sobic004G065300--Sobic002G297400
Octagon: transcription factors


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