Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G215901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4T2
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46320.1 : OsFBX173 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G220400 exonuclease, putative, expressed -
2 Sobic.002G108100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G478900 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.004G215600 - K15271: HFM1, ATP-dependent DNA helicase HFM1/MER3
5 Sobic.001G043200 expressed protein -
6 Sobic.007G116000 EDM2, putative, expressed -
7 Sobic.004G194100 expressed protein -
8 Sobic.007G119700 OsFBX8 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G211700 expressed protein -
10 Sobic.010G048900 - -
11 Sobic.009G135300 FAR1 family protein, expressed -
12 Sobic.006G262800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.009G154900 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K03531: cell division protein FtsZ
14 Sobic.001G327100 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G085950 - -
16 Sobic.009G227100 expressed protein -
17 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144
18 Sobic.005G123400 expressed protein -
19 Sobic.001G277300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsFBX351 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G398500 Mo25, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39


Gene co-expression network
sample Sobic009G215901 Sobic009G215901 Sobic006G220400 Sobic006G220400 Sobic009G215901--Sobic006G220400 Sobic002G108100 Sobic002G108100 Sobic009G215901--Sobic002G108100 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic009G215901--Sobic001G478900 Sobic004G215600 Sobic004G215600 Sobic009G215901--Sobic004G215600 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic009G215901--Sobic001G043200 Sobic007G116000 Sobic007G116000 Sobic009G215901--Sobic007G116000 Sobic004G194100 Sobic004G194100 Sobic009G215901--Sobic004G194100 Sobic007G119700 Sobic007G119700 Sobic009G215901--Sobic007G119700 Sobic003G211700 Sobic003G211700 Sobic009G215901--Sobic003G211700 Sobic006G220400--Sobic001G043200 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic006G220400--Sobic005G123400 Sobic009G227100 Sobic009G227100 Sobic006G220400--Sobic009G227100 Sobic006G012300 Sobic006G012300 Sobic006G220400--Sobic006G012300 Sobic001G203600 Sobic001G203600 Sobic006G220400--Sobic001G203600 Sobic006G103700 Sobic006G103700 Sobic006G220400--Sobic006G103700 Sobic007G204000 Sobic007G204000 Sobic006G220400--Sobic007G204000 Sobic006G220400--Sobic004G194100 Sobic004G334200 Sobic004G334200 Sobic006G220400--Sobic004G334200 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic002G108100--Sobic003G342500 Sobic008G155400 Sobic008G155400 Sobic002G108100--Sobic008G155400 Sobic005G045800 Sobic005G045800 Sobic002G108100--Sobic005G045800 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic002G108100--Sobic009G066200 Sobic003G200000 Sobic003G200000 Sobic002G108100--Sobic003G200000 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic002G108100--Sobic003G352900 Sobic007G189100 Sobic007G189100 Sobic002G108100--Sobic007G189100 Sobic007G118050 Sobic007G118050 Sobic002G108100--Sobic007G118050 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic002G108100--Sobic001G131900 Sobic008G095900 Sobic008G095900 Sobic001G478900--Sobic008G095900 Sobic006G262800 Sobic006G262800 Sobic001G478900--Sobic006G262800 Sobic004G256900 Sobic004G256900 Sobic001G478900--Sobic004G256900 Sobic003G184300 Sobic003G184300 Sobic001G478900--Sobic003G184300 Sobic009G047700 Sobic009G047700 Sobic001G478900--Sobic009G047700 Sobic004G051600 Sobic004G051600 Sobic001G478900--Sobic004G051600 Sobic010G068900 Sobic010G068900 Sobic001G478900--Sobic010G068900 Sobic009G253101 Sobic009G253101 Sobic001G478900--Sobic009G253101 Sobic010G123100 Sobic010G123100 Sobic001G478900--Sobic010G123100 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic004G215600--Sobic009G120400 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic004G215600--Sobic003G194800 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic004G215600--Sobic008G047500 Sobic007G186400 Sobic007G186400 Sobic004G215600--Sobic007G186400 Sobic004G215600--Sobic008G095900 Sobic006G095000 Sobic006G095000 Sobic004G215600--Sobic006G095000 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic004G215600--Sobic008G085950 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic004G215600--Sobic002G173400 Sobic004G215600--Sobic001G043200 Sobic001G043200--Sobic005G123400 Sobic003G190200 Sobic003G190200 Sobic001G043200--Sobic003G190200 Sobic003G021600 Sobic003G021600 Sobic001G043200--Sobic003G021600 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic001G043200--Sobic003G394500 Sobic009G122500 Sobic009G122500 Sobic001G043200--Sobic009G122500 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic001G043200--Sobic007G030100 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic001G043200--Sobic004G122900 Sobic009G154900 Sobic009G154900 Sobic001G043200--Sobic009G154900 Sobic001G043200--Sobic003G194800 Sobic002G322700 Sobic002G322700 Sobic007G116000--Sobic002G322700 Sobic003G066700 Sobic003G066700 Sobic007G116000--Sobic003G066700 Sobic009G135300 Sobic009G135300 Sobic007G116000--Sobic009G135300 Sobic002G203600 Sobic002G203600 Sobic007G116000--Sobic002G203600 Sobic009G024900 Sobic009G024900 Sobic007G116000--Sobic009G024900 Sobic001G327100 Sobic001G327100 Sobic007G116000--Sobic001G327100 Sobic007G116000--Sobic007G118050 Sobic007G116000--Sobic009G215901 Sobic007G116000--Sobic008G085950 Sobic003G113300 Sobic003G113300 Sobic004G194100--Sobic003G113300 Sobic004G194100--Sobic006G220400 Sobic002G364900 Sobic002G364900 Sobic004G194100--Sobic002G364900 Sobic004G194100--Sobic009G154900 Sobic002G399900 Sobic002G399900 Sobic004G194100--Sobic002G399900 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic004G194100--Sobic001G051400 Sobic004G194100--Sobic005G123400 Sobic002G386600 Sobic002G386600 Sobic004G194100--Sobic002G386600 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic004G194100--Sobic003G393200 Sobic001G152700 Sobic001G152700 Sobic007G119700--Sobic001G152700 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic007G119700--Sobic010G160300 Sobic002G397900 Sobic002G397900 Sobic007G119700--Sobic002G397900 Sobic001G280500 Sobic001G280500 Sobic007G119700--Sobic001G280500 Sobic007G119700--Sobic001G043200 Sobic002G348400 Sobic002G348400 Sobic007G119700--Sobic002G348400 Sobic002G023100 Sobic002G023100 Sobic007G119700--Sobic002G023100 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic007G119700--Sobic002G304700 Sobic001G498800 Sobic001G498800 Sobic007G119700--Sobic001G498800 Sobic007G115900 Sobic007G115900 Sobic003G211700--Sobic007G115900 Sobic004G316800 Sobic004G316800 Sobic003G211700--Sobic004G316800 Sobic007G053400 Sobic007G053400 Sobic003G211700--Sobic007G053400 Sobic007G158900 Sobic007G158900 Sobic003G211700--Sobic007G158900 Sobic003G113400 Sobic003G113400 Sobic003G211700--Sobic003G113400 Sobic007G212800 Sobic007G212800 Sobic003G211700--Sobic007G212800 Sobic005G178950 Sobic005G178950 Sobic003G211700--Sobic005G178950 Sobic010G048900 Sobic010G048900 Sobic003G211700--Sobic010G048900 Sobic003G131300 Sobic003G131300 Sobic003G211700--Sobic003G131300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.