Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G245500.1
Synonym RD26, ANAC072
Functional annotation no apical meristem protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PA73
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31719 PTHR31719:SF40
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G27410 : NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g04960.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7B02G499400
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G237350 - -
2 Sobic.004G087200 flavonol-3-O-glycoside-7-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
3 Sobic.002G284600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSAUR39 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
4 Sobic.003G301400 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03509: DNA polymerase eta
5 Sobic.008G083600 nodulation protein-related, putative, expressed -
6 Sobic.008G178300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G054901 - -
8 Sobic.003G147900 expressed protein -
9 Sobic.002G264100 transcription factor RF2a, putative, expressed -
10 Sobic.008G178200 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G292500 ATP-dependent protease La, putative, expressed K11793: cereblon
12 Sobic.010G091366 - -
13 Sobic.001G472666 - -
14 Sobic.003G440100 EF hand family protein, expressed -
15 Sobic.009G247601 - -
16 Sobic.004G338400 "TH1(Ortholog in rice:Li et al., 2012)"(PubMedID : 31659894)@DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G153900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G135450 - -
19 Sobic.001G122700 expressed protein -
20 Sobic.003G395600 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter


Gene co-expression network
sample Sobic009G245500 Sobic009G245500 Sobic009G237350 Sobic009G237350 Sobic009G245500--Sobic009G237350 Sobic004G087200 Sobic004G087200 Sobic009G245500--Sobic004G087200 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic009G245500--Sobic002G284600 Sobic003G301400 Sobic003G301400 Sobic009G245500--Sobic003G301400 Sobic008G083600 Sobic008G083600 Sobic009G245500--Sobic008G083600 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic009G245500--Sobic008G178300 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic009G245500--Sobic002G054901 Sobic003G147900 Sobic003G147900 Sobic009G245500--Sobic003G147900 Sobic002G264100 Sobic002G264100 Sobic009G245500--Sobic002G264100 Sobic008G178200 Sobic008G178200 Sobic009G237350--Sobic008G178200 Sobic009G237350--Sobic008G178300 Sobic009G237350--Sobic002G284600 Sobic008G100950 Sobic008G100950 Sobic009G237350--Sobic008G100950 Sobic010G091366 Sobic010G091366 Sobic009G237350--Sobic010G091366 Sobic008G153900 Sobic008G153900 Sobic009G237350--Sobic008G153900 Sobic004G338400 Sobic004G338400 Sobic009G237350--Sobic004G338400 Sobic009G237350--Sobic002G054901 Sobic003G316400 Sobic003G316400 Sobic009G237350--Sobic003G316400 Sobic004G087200--Sobic002G284600 Sobic009G022500 Sobic009G022500 Sobic004G087200--Sobic009G022500 Sobic004G087200--Sobic009G237350 Sobic004G087200--Sobic002G054901 Sobic004G087200--Sobic003G316400 Sobic004G087200--Sobic008G100950 Sobic003G311250 Sobic003G311250 Sobic004G087200--Sobic003G311250 Sobic009G011800 Sobic009G011800 Sobic004G087200--Sobic009G011800 Sobic004G087200--Sobic010G091366 Sobic002G284600--Sobic009G237350 Sobic002G284600--Sobic008G178300 Sobic002G284600--Sobic008G178200 Sobic003G395600 Sobic003G395600 Sobic002G284600--Sobic003G395600 Sobic002G284600--Sobic002G054901 Sobic003G009501 Sobic003G009501 Sobic002G284600--Sobic003G009501 Sobic002G284600--Sobic004G087200 Sobic002G284600--Sobic003G311250 Sobic010G222600 Sobic010G222600 Sobic002G284600--Sobic010G222600 Sobic003G301400--Sobic003G395600 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic003G301400--Sobic010G056100 Sobic010G195100 Sobic010G195100 Sobic003G301400--Sobic010G195100 Sobic003G301400--Sobic002G284600 Sobic009G184900 Sobic009G184900 Sobic003G301400--Sobic009G184900 Sobic007G177700 Sobic007G177700 Sobic003G301400--Sobic007G177700 Sobic004G128100 Sobic004G128100 Sobic003G301400--Sobic004G128100 Sobic003G292500 Sobic003G292500 Sobic003G301400--Sobic003G292500 Sobic001G215700 Sobic001G215700 Sobic003G301400--Sobic001G215700 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic008G083600--Sobic006G007700 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic008G083600--Sobic007G003250 Sobic008G060400 Sobic008G060400 Sobic008G083600--Sobic008G060400 Sobic005G148300 Sobic005G148300 Sobic008G083600--Sobic005G148300 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic008G083600--Sobic003G419100 Sobic002G163950 Sobic002G163950 Sobic008G083600--Sobic002G163950 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic008G083600--Sobic001G355850 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic008G083600--Sobic001G369701 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic008G083600--Sobic001G519500 Sobic008G178300--Sobic008G178200 Sobic008G178300--Sobic009G237350 Sobic008G178300--Sobic002G284600 Sobic001G490700 Sobic001G490700 Sobic008G178300--Sobic001G490700 Sobic004G250100 Sobic004G250100 Sobic008G178300--Sobic004G250100 Sobic005G094001 Sobic005G094001 Sobic008G178300--Sobic005G094001 Sobic003G433600 Sobic003G433600 Sobic008G178300--Sobic003G433600 Sobic003G202700 Sobic003G202700 Sobic008G178300--Sobic003G202700 Sobic007G179500 Sobic007G179500 Sobic008G178300--Sobic007G179500 Sobic004G281750 Sobic004G281750 Sobic002G054901--Sobic004G281750 Sobic002G054901--Sobic008G153900 Sobic003G188900 Sobic003G188900 Sobic002G054901--Sobic003G188900 Sobic002G054901--Sobic002G284600 Sobic002G054901--Sobic009G237350 Sobic002G054901--Sobic008G100950 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic002G054901--Sobic007G141001 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic002G054901--Sobic010G103000 Sobic004G131350 Sobic004G131350 Sobic002G054901--Sobic004G131350 Sobic003G147900--Sobic010G103000 Sobic003G147900--Sobic003G188900 Sobic004G078400 Sobic004G078400 Sobic003G147900--Sobic004G078400 Sobic001G502300 Sobic001G502300 Sobic003G147900--Sobic001G502300 Sobic001G528000 Sobic001G528000 Sobic003G147900--Sobic001G528000 Sobic001G509000 Sobic001G509000 Sobic003G147900--Sobic001G509000 Sobic001G267400 Sobic001G267400 Sobic003G147900--Sobic001G267400 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G147900--Sobic001G267950 Sobic003G147900--Sobic004G131350 Sobic001G205600 Sobic001G205600 Sobic002G264100--Sobic001G205600 Sobic003G440100 Sobic003G440100 Sobic002G264100--Sobic003G440100 Sobic009G247601 Sobic009G247601 Sobic002G264100--Sobic009G247601 Sobic002G264100--Sobic010G091366 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic002G264100--Sobic003G318350 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic002G264100--Sobic007G003300 Sobic002G292400 Sobic002G292400 Sobic002G264100--Sobic002G292400 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic002G264100--Sobic006G223700 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic002G264100--Sobic003G146450
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.