Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G472666.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAX6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g09270.1 : ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001243
Brachypodium KQK13052 , KQK13053
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G301400 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03509: DNA polymerase eta
2 Sobic.003G265900 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.004G073100 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
4 Sobic.003G041000 holocarboxylase synthetase, putative, expressed -
5 Sobic.003G395600 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
6 Sobic.001G086600 expressed protein -
7 Sobic.006G082600 OsFBX133 - F-box domain containing protein, expressed K10295: F-box protein 9
8 Sobic.010G195100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G099800 expressed protein K14376: poly(A) polymerase
10 Sobic.001G212100 GEM, putative, expressed -
11 Sobic.010G263001 - -
12 Sobic.001G359900 expressed protein -
13 Sobic.004G024700 RNA polymerase II transcription factor B subunit 4, putative, expressed K03143: TFIIH3, GTF2H3, transcription initiation factor TFIIH subunit 3
14 Sobic.010G012100 expressed protein K18735: protein SMG9
15 Sobic.009G184900 OsDegp8 - Putative Deg protease homologue, expressed -
16 Sobic.009G245500 no apical meristem protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G083600 nodulation protein-related, putative, expressed -
18 Sobic.001G092100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K17890: autophagy-related protein 16-1
19 Sobic.004G262000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G299000 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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