Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G246200.1
Synonym Sb09g029710
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
secretory protein, putative, expressed
UniProt C5YWG5
Pfam PF04450
Panther DB PTHR33321 PTHR33321:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42900 : Plant basic secretory protein (BSP) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g50500.1 : secretory protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036714 , Zm00025a044718
Brachypodium KQK04689
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G075500 CESA8 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
2 Sobic.009G063400 "CESA1-like or CESA10-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA1 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
3 Sobic.009G232200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@fasciclin domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G191000 lipoxygenase, putative, expressed K00454: lipoxygenase
5 Sobic.005G096101 - -
6 Sobic.009G221900 seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@LTPL152 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.003G095700 glycosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.009G215000 - -
9 Sobic.007G114500 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K01784: galE, UDP-glucose 4-epimerase
10 Sobic.002G118700 -(PubMedID : 28944535)@CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
11 Sobic.004G116800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G252000 CHIT13 - Chitinase family protein precursor, expressed -
13 Sobic.001G464600 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.002G347300 copper methylamine oxidase precursor, putative, expressed K00276: AOC3, AOC2, primary-amine oxidase
15 Sobic.001G334900 X8 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G338400 uncharacterized secreted protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G333100 expressed protein -
18 Sobic.009G026101 - -
19 Sobic.009G236100 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
20 Sobic.007G180900 BAG domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G246200 Sobic009G246200 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic009G246200--Sobic002G075500 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic009G246200--Sobic009G063400 Sobic009G232200 Sobic009G232200 Sobic009G246200--Sobic009G232200 Sobic008G191000 Sobic008G191000 Sobic009G246200--Sobic008G191000 Sobic005G096101 Sobic005G096101 Sobic009G246200--Sobic005G096101 Sobic009G221900 Sobic009G221900 Sobic009G246200--Sobic009G221900 Sobic003G095700 Sobic003G095700 Sobic009G246200--Sobic003G095700 Sobic009G215000 Sobic009G215000 Sobic009G246200--Sobic009G215000 Sobic007G114500 Sobic007G114500 Sobic009G246200--Sobic007G114500 Sobic002G075500--Sobic009G063400 Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic002G075500--Sobic009G125900 Sobic002G118700 Sobic002G118700 Sobic002G075500--Sobic002G118700 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic002G075500--Sobic009G026101 Sobic004G051300 Sobic004G051300 Sobic002G075500--Sobic004G051300 Sobic001G099100 Sobic001G099100 Sobic002G075500--Sobic001G099100 Sobic007G180900 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Octagon: transcription factors


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