Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G004600.2
Synonym Sb10g000630, EMB2769
Functional annotation CWC15 homolog A, putative, expressed
UniProt C5Z259
Pfam PF04889
Panther DB PTHR12718
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005681; spliceosomal complex GO:0000398mRNA splicing, via spliceosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13200 : Cwf15 / Cwc15 cell cycle control family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g01700.1 : CWC15 homolog A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022887 , Zm00025a035937
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G085560.6 , HORVU5Hr1G085560.5 , HORVU5Hr1G085560.4 , HORVU5Hr1G085560.3 , HORVU5Hr1G085560.2 , HORVU5Hr1G085560.1 , HORVU7Hr1G001880.6 , HORVU7Hr1G001880.4 , HORVU7Hr1G001880.5 , HORVU7Hr1G001880.3 , HORVU7Hr1G001880.1
Wheat TraesCS5A02G341300 , TraesCS5D02G346900 , TraesCS5D02G346900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G004600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic010G004600 Sobic010G004600 Sobic010G004701 Sobic010G004701 Sobic010G004600--Sobic010G004701 Sobic007G189200 Sobic007G189200 Sobic010G004600--Sobic007G189200 Sobic006G142266 Sobic006G142266 Sobic010G004600--Sobic006G142266 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic010G004600--Sobic003G096500 Sobic008G003300 Sobic008G003300 Sobic010G004600--Sobic008G003300 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic010G004600--Sobic001G309800 Sobic005G060700 Sobic005G060700 Sobic010G004600--Sobic005G060700 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic010G004600--Sobic005G163866 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic010G004600--Sobic005G159801 Sobic010G004701--Sobic010G004600 Sobic006G123500 Sobic006G123500 Sobic010G004701--Sobic006G123500 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic010G004701--Sobic004G122100 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic010G004701--Sobic003G080800 Sobic001G342800 Sobic001G342800 Sobic010G004701--Sobic001G342800 Sobic005G175500 Sobic005G175500 Sobic010G004701--Sobic005G175500 Sobic006G165600 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Octagon: transcription factors


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