Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G035900.1
Synonym Sb10g003220
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z3X6
Pfam -
Panther DB PTHR33120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G092000 resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G396400 expressed protein -
3 Sobic.001G132800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CAMK_CAMK_like.21 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
4 Sobic.008G087400 - -
5 Sobic.009G027800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@phospholipase C, putative, expressed K05857: phosphatidylinositol phospholipase C, delta
6 Sobic.005G110490 - -
7 Sobic.007G172500 zinc finger family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G167000 "C3 PTPC, housekeeping gene"(PubMedID : 2308851)@phosphoenolphyruvate carboxylase(PubMedID : 26904072)@phosphoenolpyruvate carboxylase, putative, expressed K01595: phosphoenolpyruvate carboxylase
9 Sobic.004G172100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
10 Sobic.003G019700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.004G257800 chloride transporter, chloride channel family, putative, expressed -
12 Sobic.009G015166 - -
13 Sobic.002G081850 - -
14 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.010G170300 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
16 Sobic.006G117500 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.005G152500 - -
18 Sobic.007G054500 ABC-2 type transporter domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.005G149600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G035900 Sobic010G035900 Sobic005G092000 Sobic005G092000 Sobic010G035900--Sobic005G092000 Sobic001G396400 Sobic001G396400 Sobic010G035900--Sobic001G396400 Sobic001G132800 Sobic001G132800 Sobic010G035900--Sobic001G132800 Sobic008G087400 Sobic008G087400 Sobic010G035900--Sobic008G087400 Sobic009G027800 Sobic009G027800 Sobic010G035900--Sobic009G027800 Sobic005G110490 Sobic005G110490 Sobic010G035900--Sobic005G110490 Sobic007G172500 Sobic007G172500 Sobic010G035900--Sobic007G172500 Sobic002G167000 Sobic002G167000 Sobic010G035900--Sobic002G167000 Sobic004G172100 Sobic004G172100 Sobic010G035900--Sobic004G172100 Sobic005G092000--Sobic010G035900 Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic005G092000--Sobic002G081800 Sobic005G022200 Sobic005G022200 Sobic005G092000--Sobic005G022200 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G092000--Sobic002G081850 Sobic005G092000--Sobic007G172500 Sobic005G092000--Sobic002G167000 Sobic005G092000--Sobic004G172100 Sobic004G339800 Sobic004G339800 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Sobic004G172100--Sobic009G099000 Sobic004G172100--Sobic004G257800 Sobic001G294400 Sobic001G294400 Sobic004G172100--Sobic001G294400
Octagon: transcription factors


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