Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G087400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G035900 expressed protein -
2 Sobic.005G110490 - -
3 Sobic.005G092000 resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G116801 - -
5 Sobic.001G396400 expressed protein -
6 Sobic.007G172500 zinc finger family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G167000 "C3 PTPC, housekeeping gene"(PubMedID : 2308851)@phosphoenolphyruvate carboxylase(PubMedID : 26904072)@phosphoenolpyruvate carboxylase, putative, expressed K01595: phosphoenolpyruvate carboxylase
8 Sobic.004G159100 exostosin family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G321500 ras-related protein, putative, expressed K07976: Rab family, other
10 Sobic.004G172100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.001G132800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CAMK_CAMK_like.21 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
12 Sobic.010G170300 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
13 Sobic.002G075500 CESA8 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
14 Sobic.007G054500 ABC-2 type transporter domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G108800 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.008G043500 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G156800 "SGL1(Ortholog in rice:Nakagawa et al., 2012)"(PubMedID : 31659907)@expressed protein -
18 Sobic.004G257800 chloride transporter, chloride channel family, putative, expressed -
19 Sobic.002G332100 expressed protein -
20 Sobic.001G424000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@fringe-related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G087400 Sobic008G087400 Sobic010G035900 Sobic010G035900 Sobic008G087400--Sobic010G035900 Sobic005G110490 Sobic005G110490 Sobic008G087400--Sobic005G110490 Sobic005G092000 Sobic005G092000 Sobic008G087400--Sobic005G092000 Sobic006G116801 Sobic006G116801 Sobic008G087400--Sobic006G116801 Sobic001G396400 Sobic001G396400 Sobic008G087400--Sobic001G396400 Sobic007G172500 Sobic007G172500 Sobic008G087400--Sobic007G172500 Sobic002G167000 Sobic002G167000 Sobic008G087400--Sobic002G167000 Sobic004G159100 Sobic004G159100 Sobic008G087400--Sobic004G159100 Sobic002G321500 Sobic002G321500 Sobic008G087400--Sobic002G321500 Sobic010G035900--Sobic005G092000 Sobic010G035900--Sobic001G396400 Sobic001G132800 Sobic001G132800 Sobic010G035900--Sobic001G132800 Sobic010G035900--Sobic008G087400 Sobic009G027800 Sobic009G027800 Sobic010G035900--Sobic009G027800 Sobic010G035900--Sobic005G110490 Sobic010G035900--Sobic007G172500 Sobic010G035900--Sobic002G167000 Sobic004G172100 Sobic004G172100 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Octagon: transcription factors


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