Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G037500.1
Synonym Sb10g003330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z3Y8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05540.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050034
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G158000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@PHS1, putative, expressed K14165: atypical dual specificity phosphatase
2 Sobic.006G218200 expressed protein -
3 Sobic.009G037700 signal recognition particle receptor, putative, expressed K13431: signal recognition particle receptor subunit alpha
4 Sobic.003G211900 expressed protein -
5 Sobic.002G174100 - -
6 Sobic.004G276800 expressed protein -
7 Sobic.009G020300 one zinc finger protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G407300 expressed protein -
10 Sobic.003G183200 OsFBX249 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G138401 - -
12 Sobic.001G538350 - -
13 Sobic.008G002201 - -
14 Sobic.002G061500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G437050 - -
16 Sobic.007G060400 - -
17 Sobic.010G086100 SKIP/SNW domain containing protein, expressed K06063: SNW1, SKIIP, SNW domain-containing protein 1
18 Sobic.009G167400 KIP1, putative, expressed -
19 Sobic.001G330775 - -
20 Sobic.003G183100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G037500 Sobic010G037500 Sobic003G158000 Sobic003G158000 Sobic010G037500--Sobic003G158000 Sobic006G218200 Sobic006G218200 Sobic010G037500--Sobic006G218200 Sobic009G037700 Sobic009G037700 Sobic010G037500--Sobic009G037700 Sobic003G211900 Sobic003G211900 Sobic010G037500--Sobic003G211900 Sobic002G174100 Sobic002G174100 Sobic010G037500--Sobic002G174100 Sobic004G276800 Sobic004G276800 Sobic010G037500--Sobic004G276800 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic010G037500--Sobic009G020300 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic010G037500--Sobic001G210600 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic010G037500--Sobic001G407300 Sobic003G158000--Sobic009G037700 Sobic003G158000--Sobic006G218200 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic003G158000--Sobic001G186700 Sobic007G125200 Sobic007G125200 Sobic003G158000--Sobic007G125200 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic003G158000--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic003G158000--Sobic010G086100 Sobic002G402100 Sobic002G402100 Sobic003G158000--Sobic002G402100 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic003G158000--Sobic002G027901 Sobic003G158000--Sobic010G037500 Sobic006G218200--Sobic009G037700 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic006G218200--Sobic008G188800 Sobic008G070600 Sobic008G070600 Sobic006G218200--Sobic008G070600 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic006G218200--Sobic001G457500 Sobic006G219801 Sobic006G219801 Sobic006G218200--Sobic006G219801 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic006G218200--Sobic007G144100 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic006G218200--Sobic010G058300 Sobic009G047066 Sobic009G047066 Sobic006G218200--Sobic009G047066 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic006G218200--Sobic003G072700 Sobic009G037700--Sobic006G218200 Sobic009G037700--Sobic009G138401 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic009G037700--Sobic003G066300 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic009G037700--Sobic004G288000 Sobic001G332400 Sobic001G332400 Sobic009G037700--Sobic001G332400 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic009G037700--Sobic008G095766 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic009G037700--Sobic001G003400 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic009G037700--Sobic004G031900 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic009G037700--Sobic002G193200 Sobic002G382900 Sobic002G382900 Sobic003G211900--Sobic002G382900 Sobic007G060400 Sobic007G060400 Sobic003G211900--Sobic007G060400 Sobic003G211900--Sobic004G276800 Sobic004G210300 Sobic004G210300 Sobic003G211900--Sobic004G210300 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic003G211900--Sobic003G079532 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic003G211900--Sobic004G186400 Sobic002G350100 Sobic002G350100 Sobic003G211900--Sobic002G350100 Sobic003G211900--Sobic002G174100 Sobic003G211900--Sobic008G095766 Sobic002G174100--Sobic008G095766 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic002G174100--Sobic007G090439 Sobic003G374400 Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G079532 Sobic002G174100--Sobic001G003400 Sobic002G174100--Sobic002G193200 Sobic010G027400 Sobic010G027400 Sobic002G174100--Sobic010G027400 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic002G174100--Sobic008G191900 Sobic002G174100--Sobic001G332400 Sobic004G276800--Sobic002G382900 Sobic004G276800--Sobic003G211900 Sobic004G276800--Sobic007G060400 Sobic004G276800--Sobic002G174100 Sobic004G276800--Sobic008G095766 Sobic004G276800--Sobic003G079532 Sobic004G276800--Sobic010G027400 Sobic004G276800--Sobic004G186400 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic004G276800--Sobic006G172400 Sobic009G020300--Sobic001G210600 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic009G020300--Sobic003G183100 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic009G020300--Sobic008G002201 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic001G538350 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic009G138401 Sobic009G020300--Sobic010G086100 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic008G183600 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic009G020300--Sobic001G155100 Sobic001G210600--Sobic008G002201 Sobic001G210600--Sobic003G183100 Sobic001G210600--Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic001G538350 Sobic001G210600--Sobic001G155100 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic001G210600--Sobic005G220680 Sobic001G210600--Sobic007G209900 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic001G210600--Sobic010G030500 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic001G210600--Sobic004G168150 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic001G407300--Sobic010G261900 Sobic010G279600 Sobic010G279600 Sobic001G407300--Sobic010G279600 Sobic004G289100 Sobic004G289100 Sobic001G407300--Sobic004G289100 Sobic004G281500 Sobic004G281500 Sobic001G407300--Sobic004G281500 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic001G407300--Sobic009G044200 Sobic001G152800 Sobic001G152800 Sobic001G407300--Sobic001G152800 Sobic004G008500 Sobic004G008500 Sobic001G407300--Sobic004G008500 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic001G407300--Sobic005G067200 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic001G407300--Sobic003G211000
Octagon: transcription factors


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