Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G117600.1
Synonym Sb10g010400
Functional annotation DUF538 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A194YJL6
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09310 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02850.1 : DUF538 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009479 , Zm00025a044909 , Zm00025a009480 , Zm00025a044910
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G117800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
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11 Sobic.008G127933 - -
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14 Sobic.002G391800 peroxidase, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.007G204700 expressed protein -
16 Sobic.006G277700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.005G065900 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G425000 VQ domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G242100 expressed protein -
20 Sobic.004G322800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant


Gene co-expression network
sample Sobic010G117600 Sobic010G117600 Sobic010G117800 Sobic010G117800 Sobic010G117600--Sobic010G117800 Sobic005G216200 Sobic005G216200 Sobic010G117600--Sobic005G216200 Sobic010G117300 Sobic010G117300 Sobic010G117600--Sobic010G117300 Sobic003G364200 Sobic003G364200 Sobic010G117600--Sobic003G364200 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic010G117600--Sobic005G066100 Sobic008G128200 Sobic008G128200 Sobic010G117600--Sobic008G128200 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic010G117600--Sobic005G066432 Sobic008G128066 Sobic008G128066 Sobic010G117600--Sobic008G128066 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic010G117600--Sobic006G079300 Sobic010G117800--Sobic010G117600 Sobic010G117800--Sobic005G216200 Sobic010G117800--Sobic010G117300 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic010G117800--Sobic007G158600 Sobic010G117800--Sobic005G066100 Sobic002G425000 Sobic002G425000 Sobic010G117800--Sobic002G425000 Sobic008G127933 Sobic008G127933 Sobic010G117800--Sobic008G127933 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic010G117800--Sobic005G160700 SobicK026900 SobicK026900 Sobic010G117800--SobicK026900 Sobic005G216200--Sobic010G117800 Sobic005G216200--Sobic010G117600 Sobic010G117500 Sobic010G117500 Sobic005G216200--Sobic010G117500 Sobic005G216200--Sobic010G117300 Sobic006G255400 Sobic006G255400 Sobic005G216200--Sobic006G255400 Sobic004G008900 Sobic004G008900 Sobic005G216200--Sobic004G008900 Sobic005G216200--Sobic007G158600 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic005G216200--Sobic002G391800 Sobic001G234900 Sobic001G234900 Sobic005G216200--Sobic001G234900 Sobic010G117300--Sobic010G117800 Sobic010G117300--Sobic010G117600 Sobic010G117300--Sobic005G216200 Sobic002G329100 Sobic002G329100 Sobic010G117300--Sobic002G329100 Sobic007G078100 Sobic007G078100 Sobic010G117300--Sobic007G078100 Sobic002G126600 Sobic002G126600 Sobic010G117300--Sobic002G126600 Sobic006G199100 Sobic006G199100 Sobic010G117300--Sobic006G199100 Sobic009G043600 Sobic009G043600 Sobic010G117300--Sobic009G043600 Sobic001G196300 Sobic001G196300 Sobic010G117300--Sobic001G196300 Sobic003G364200--Sobic008G128066 Sobic003G364200--Sobic008G128200 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic003G364200--Sobic007G204700 Sobic005G215400 Sobic005G215400 Sobic003G364200--Sobic005G215400 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic003G364200--Sobic010G045500 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic003G364200--Sobic004G322800 Sobic003G364200--Sobic008G127933 Sobic003G364200--Sobic005G160700 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic003G364200--Sobic006G122800 Sobic005G066100--Sobic005G066432 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic005G066100--Sobic004G202400 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic005G066100--Sobic005G065900 Sobic005G066100--SobicK026900 Sobic005G066100--Sobic007G204700 Sobic005G066100--Sobic002G425000 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic005G066100--Sobic010G148800 Sobic005G066100--Sobic008G127933 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic005G066100--Sobic010G158500 Sobic008G128200--Sobic007G204700 Sobic008G128200--Sobic008G128066 Sobic008G128200--Sobic010G045500 Sobic008G128200--Sobic003G364200 Sobic006G078900 Sobic006G078900 Sobic008G128200--Sobic006G078900 Sobic008G128200--Sobic008G127933 Sobic008G128200--Sobic005G215400 Sobic005G069800 Sobic005G069800 Sobic008G128200--Sobic005G069800 Sobic008G128200--Sobic005G066100 Sobic005G066432--Sobic005G065900 Sobic005G066432--Sobic010G148800 Sobic005G066432--Sobic005G066100 Sobic005G066432--Sobic006G079300 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic005G066432--Sobic006G277700 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic005G066432--Sobic003G020200 Sobic004G009400 Sobic004G009400 Sobic005G066432--Sobic004G009400 Sobic005G066432--Sobic005G160700 Sobic005G066432--Sobic004G322800 Sobic008G128066--Sobic008G127933 Sobic008G128066--Sobic007G204700 Sobic008G128066--Sobic008G128200 Sobic008G128066--Sobic006G078900 Sobic008G128066--Sobic003G364200 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic008G128066--Sobic002G093700 Sobic008G128066--Sobic005G066100 Sobic008G128066--Sobic002G425000 Sobic001G237900 Sobic001G237900 Sobic008G128066--Sobic001G237900 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G438200 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic006G079300--Sobic001G242100 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic005G160700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G229000 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic006G079300--Sobic001G379400 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic004G322800 Sobic006G079300--Sobic010G148800
Octagon: transcription factors


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