Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G060401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4V1
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF73
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46500.1 : OsFBX21 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G442700 - -
2 Sobic.004G001300 -(PubMedID : 26976818)@erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15893: glycerate dehydrogenase
3 Sobic.002G358500 - -
4 Sobic.002G347600 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G000700 expressed protein -
6 Sobic.001G098301 - -
7 Sobic.009G191100 expressed protein -
8 Sobic.001G048400 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G468700 expressed protein -
10 Sobic.004G121400 CAX 1c(PubMedID : 22196357)@cation exchanger 3(PubMedID : 26320239)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K07300: chaA, Ca2+:H+ antiporter
11 Sobic.010G043800 uncharacterized protein ycf45, putative, expressed -
12 Sobic.003G137100 protoporphyrinogen oxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K00231: PPOX, protoporphyrinogen/coproporphyrinogen III oxidase
13 Sobic.002G359600 GA22009-PA, putative, expressed -
14 Sobic.001G065600 -(PubMedID : 26976818)@hydroxyacid oxidase 1, putative, expressed K11517: (S)-2-hydroxy-acid oxidase
15 Sobic.004G359700 - -
16 Sobic.009G121000 expressed protein -
17 Sobic.002G172700 Galactose mutarotase-like superfamily protein(PubMedID : 26465154)@aldose 1-epimerase, putative, expressed K01792: glucose-6-phosphate 1-epimerase
18 Sobic.001G536800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K03768: PPIB, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (cyclophilin B)
19 Sobic.006G038500 tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed K05539: tRNA-dihydrouridine synthase A
20 Sobic.004G308700 photosystem I light harvesting complex gene 5(PubMedID : 26465154)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08911: light-harvesting complex I chlorophyll a/b binding protein 5


Gene co-expression network
sample Sobic001G060401 Sobic001G060401 Sobic003G442700 Sobic003G442700 Sobic001G060401--Sobic003G442700 Sobic004G001300 Sobic004G001300 Sobic001G060401--Sobic004G001300 Sobic002G358500 Sobic002G358500 Sobic001G060401--Sobic002G358500 Sobic002G347600 Sobic002G347600 Sobic001G060401--Sobic002G347600 Sobic002G000700 Sobic002G000700 Sobic001G060401--Sobic002G000700 Sobic001G098301 Sobic001G098301 Sobic001G060401--Sobic001G098301 Sobic009G191100 Sobic009G191100 Sobic001G060401--Sobic009G191100 Sobic001G048400 Sobic001G048400 Sobic001G060401--Sobic001G048400 Sobic001G468700 Sobic001G468700 Sobic001G060401--Sobic001G468700 Sobic001G465700 Sobic001G465700 Sobic003G442700--Sobic001G465700 Sobic004G235600 Sobic004G235600 Sobic003G442700--Sobic004G235600 Sobic008G001900 Sobic008G001900 Sobic003G442700--Sobic008G001900 Sobic003G332700 Sobic003G332700 Sobic003G442700--Sobic003G332700 Sobic009G121000 Sobic009G121000 Sobic003G442700--Sobic009G121000 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic003G442700--Sobic002G042500 Sobic003G442700--Sobic001G060401 Sobic003G442700--Sobic004G001300 Sobic001G073900 Sobic001G073900 Sobic003G442700--Sobic001G073900 Sobic001G118100 Sobic001G118100 Sobic004G001300--Sobic001G118100 Sobic007G204900 Sobic007G204900 Sobic004G001300--Sobic007G204900 Sobic008G001000 Sobic008G001000 Sobic004G001300--Sobic008G001000 Sobic004G001300--Sobic003G442700 Sobic003G161000 Sobic003G161000 Sobic004G001300--Sobic003G161000 Sobic004G001300--Sobic001G098301 Sobic003G003600 Sobic003G003600 Sobic004G001300--Sobic003G003600 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic004G001300--Sobic003G137100 Sobic004G001300--Sobic001G060401 Sobic002G358500--Sobic009G191100 Sobic004G359700 Sobic004G359700 Sobic002G358500--Sobic004G359700 Sobic002G121600 Sobic002G121600 Sobic002G358500--Sobic002G121600 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic002G358500--Sobic007G113800 Sobic002G358500--Sobic002G000700 Sobic002G358500--Sobic001G060401 Sobic004G112600 Sobic004G112600 Sobic002G358500--Sobic004G112600 Sobic002G358500--Sobic001G468700 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G358500--Sobic002G343901 Sobic006G038500 Sobic006G038500 Sobic002G347600--Sobic006G038500 Sobic003G301300 Sobic003G301300 Sobic002G347600--Sobic003G301300 Sobic004G336200 Sobic004G336200 Sobic002G347600--Sobic004G336200 Sobic008G091400 Sobic008G091400 Sobic002G347600--Sobic008G091400 Sobic006G128300 Sobic006G128300 Sobic002G347600--Sobic006G128300 Sobic003G247400 Sobic003G247400 Sobic002G347600--Sobic003G247400 Sobic003G141100 Sobic003G141100 Sobic002G347600--Sobic003G141100 Sobic004G328400 Sobic004G328400 Sobic002G347600--Sobic004G328400 Sobic002G347600--Sobic009G121000 Sobic002G000700--Sobic003G137100 Sobic002G000700--Sobic002G358500 Sobic007G213700 Sobic007G213700 Sobic002G000700--Sobic007G213700 Sobic002G000700--Sobic004G001300 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic002G000700--Sobic006G249050 Sobic002G000700--Sobic001G060401 Sobic002G000700--Sobic007G204900 Sobic010G164200 Sobic010G164200 Sobic002G000700--Sobic010G164200 Sobic007G150100 Sobic007G150100 Sobic002G000700--Sobic007G150100 Sobic010G043800 Sobic010G043800 Sobic001G098301--Sobic010G043800 Sobic001G098301--Sobic004G001300 Sobic005G188600 Sobic005G188600 Sobic001G098301--Sobic005G188600 Sobic001G098301--Sobic001G048400 Sobic001G098301--Sobic009G121000 Sobic001G098301--Sobic006G038500 Sobic002G000600 Sobic002G000600 Sobic001G098301--Sobic002G000600 Sobic006G101500 Sobic006G101500 Sobic001G098301--Sobic006G101500 Sobic001G098301--Sobic007G150100 Sobic009G191100--Sobic002G358500 Sobic009G191100--Sobic002G121600 Sobic009G191100--Sobic007G113800 Sobic004G182900 Sobic004G182900 Sobic009G191100--Sobic004G182900 Sobic004G299000 Sobic004G299000 Sobic009G191100--Sobic004G299000 Sobic002G031600 Sobic002G031600 Sobic009G191100--Sobic002G031600 Sobic007G173200 Sobic007G173200 Sobic009G191100--Sobic007G173200 Sobic002G228700 Sobic002G228700 Sobic009G191100--Sobic002G228700 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic009G191100--Sobic004G258700 Sobic003G398800 Sobic003G398800 Sobic001G048400--Sobic003G398800 Sobic009G056700 Sobic009G056700 Sobic001G048400--Sobic009G056700 Sobic007G103400 Sobic007G103400 Sobic001G048400--Sobic007G103400 Sobic003G431700 Sobic003G431700 Sobic001G048400--Sobic003G431700 Sobic001G048400--Sobic010G043800 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic001G048400--Sobic001G504400 Sobic001G048400--Sobic009G121000 Sobic001G048400--Sobic006G101500 Sobic006G238200 Sobic006G238200 Sobic001G048400--Sobic006G238200 Sobic010G002700 Sobic010G002700 Sobic001G468700--Sobic010G002700 Sobic003G017100 Sobic003G017100 Sobic001G468700--Sobic003G017100 Sobic004G028500 Sobic004G028500 Sobic001G468700--Sobic004G028500 Sobic001G017300 Sobic001G017300 Sobic001G468700--Sobic001G017300 Sobic001G468700--Sobic009G121000 Sobic001G468700--Sobic003G247400 Sobic003G313300 Sobic003G313300 Sobic001G468700--Sobic003G313300 Sobic003G276300 Sobic003G276300 Sobic001G468700--Sobic003G276300 Sobic003G004200 Sobic003G004200 Sobic001G468700--Sobic003G004200
Octagon: transcription factors


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