Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G358500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QF88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g01920.1 : SGR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G358500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G191100 expressed protein -
2 Sobic.004G359700 - -
3 Sobic.002G121600 myb-like DNA-binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
5 Sobic.002G000700 expressed protein -
6 Sobic.001G060401 - -
7 Sobic.004G112600 - -
8 Sobic.001G468700 expressed protein -
9 Sobic.002G343901 - -
10 Sobic.004G299000 expressed protein -
11 Sobic.003G442700 - -
12 Sobic.001G456900 expressed protein -
13 Sobic.002G151300 - -
14 Sobic.007G136800 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
15 Sobic.004G182900 PHD finger protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G003600 similar to Nodule inception protein-like(PubMedID : 29862293)@NIN, putative, expressed -
17 Sobic.003G262200 E3 ubiquitin ligase, putative, expressed K16276: K16276, zinc finger protein-like protein
18 Sobic.002G257750 - -
19 Sobic.006G228500 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed K13115: coiled-coil domain-containing protein 130
20 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G358500 Sobic002G358500 Sobic009G191100 Sobic009G191100 Sobic002G358500--Sobic009G191100 Sobic004G359700 Sobic004G359700 Sobic002G358500--Sobic004G359700 Sobic002G121600 Sobic002G121600 Sobic002G358500--Sobic002G121600 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic002G358500--Sobic007G113800 Sobic002G000700 Sobic002G000700 Sobic002G358500--Sobic002G000700 Sobic001G060401 Sobic001G060401 Sobic002G358500--Sobic001G060401 Sobic004G112600 Sobic004G112600 Sobic002G358500--Sobic004G112600 Sobic001G468700 Sobic001G468700 Sobic002G358500--Sobic001G468700 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G358500--Sobic002G343901 Sobic009G191100--Sobic002G358500 Sobic009G191100--Sobic002G121600 Sobic009G191100--Sobic007G113800 Sobic004G182900 Sobic004G182900 Sobic009G191100--Sobic004G182900 Sobic004G299000 Sobic004G299000 Sobic009G191100--Sobic004G299000 Sobic002G031600 Sobic002G031600 Sobic009G191100--Sobic002G031600 Sobic007G173200 Sobic007G173200 Sobic009G191100--Sobic007G173200 Sobic002G228700 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Octagon: transcription factors


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