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Transcriptome id Sobic.001G072250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S517
Pfam -
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G085200 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G161900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.004G288500 cytochrome P450, putative, expressed K15398: fatty acid omega-hydroxylase
4 Sobic.002G393200 CAMK_CAMK_like.36 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
5 Sobic.006G029300 expressed protein K15505: DNA repair protein RAD5
6 Sobic.002G042900 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.007G187400 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
8 Sobic.002G319200 expressed protein K11490: condensin-2 complex subunit H2
9 Sobic.K009800 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G325300 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed K15015: SLC32A, solute carrier family 32 (vesicular inhibitory amino acid transporter)
11 Sobic.002G427300 protein phosphotase protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G087300 mitotic checkpoint family protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G388000 GTPase-activating protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G073150 - K15449: tRNA wybutosine-synthesizing protein 1
15 Sobic.002G162000 - -
16 Sobic.004G176500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.001G408300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.001G183600 galactosyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.008G075100 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K03575: A/G-specific adenine glycosylase
20 Sobic.004G152200 glycosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G072250 Sobic001G072250 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic001G072250--Sobic006G085200 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic001G072250--Sobic010G161900 Sobic004G288500 Sobic004G288500 Sobic001G072250--Sobic004G288500 Sobic002G393200 Sobic002G393200 Sobic001G072250--Sobic002G393200 Sobic006G029300 Sobic006G029300 Sobic001G072250--Sobic006G029300 Sobic002G042900 Sobic002G042900 Sobic001G072250--Sobic002G042900 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic001G072250--Sobic007G187400 Sobic002G319200 Sobic002G319200 Sobic001G072250--Sobic002G319200 SobicK009800 SobicK009800 Sobic001G072250--SobicK009800 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic006G085200--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic006G085200--Sobic002G007600 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic006G085200--Sobic003G090500 Sobic004G136800 Sobic004G136800 Sobic006G085200--Sobic004G136800 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic006G085200--Sobic005G162300 Sobic002G216801 Sobic002G216801 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Octagon: transcription factors


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