Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G222550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6W2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088854 - -
2 Sobic.003G248700 saccharopine dehydrogenase, putative, expressed -
3 Sobic.005G108501 - -
4 Sobic.004G163000 expressed protein K15505: DNA repair protein RAD5
5 Sobic.003G005400 pectinesterase, putative, expressed -
6 Sobic.003G429101 - -
7 Sobic.009G184600 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
8 Sobic.002G348200 expressed protein -
9 Sobic.010G103000 expressed protein -
10 Sobic.006G118500 OsFBDUF36 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G202900 expressed protein -
12 Sobic.005G031600 F-box protein interaction domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G254500 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
14 Sobic.001G211000 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G010200 expressed protein -
16 Sobic.003G379400 PHD-finger domain containing protein, putative -
17 Sobic.010G079200 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
18 Sobic.002G147900 expressed protein -
19 Sobic.005G149650 - -
20 Sobic.006G234000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G222550 Sobic001G222550 Sobic008G088854 Sobic008G088854 Sobic001G222550--Sobic008G088854 Sobic003G248700 Sobic003G248700 Sobic001G222550--Sobic003G248700 Sobic005G108501 Sobic005G108501 Sobic001G222550--Sobic005G108501 Sobic004G163000 Sobic004G163000 Sobic001G222550--Sobic004G163000 Sobic003G005400 Sobic003G005400 Sobic001G222550--Sobic003G005400 Sobic003G429101 Sobic003G429101 Sobic001G222550--Sobic003G429101 Sobic009G184600 Sobic009G184600 Sobic001G222550--Sobic009G184600 Sobic002G348200 Sobic002G348200 Sobic001G222550--Sobic002G348200 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic001G222550--Sobic010G103000 Sobic008G088854--Sobic005G108501 Sobic008G088854--Sobic003G248700 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic008G088854--Sobic006G115400 Sobic008G088854--Sobic002G348200 Sobic008G088854--Sobic003G429101 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic008G088854--Sobic007G172900 Sobic001G220066 Sobic001G220066 Sobic008G088854--Sobic001G220066 Sobic001G318366 Sobic001G318366 Sobic008G088854--Sobic001G318366 Sobic002G157350 Sobic002G157350 Sobic008G088854--Sobic002G157350 Sobic003G248700--Sobic002G348200 Sobic003G248700--Sobic005G108501 Sobic003G248700--Sobic001G220066 Sobic003G248700--Sobic002G157350 Sobic003G248700--Sobic001G318366 Sobic002G035766 Sobic002G035766 Sobic003G248700--Sobic002G035766 Sobic004G023733 Sobic004G023733 Sobic003G248700--Sobic004G023733 Sobic003G248700--Sobic003G429101 SobicK042700 SobicK042700 Sobic003G248700--SobicK042700 Sobic005G108501--Sobic002G348200 Sobic005G108501--Sobic003G248700 Sobic005G108501--Sobic001G220066 Sobic005G108501--Sobic002G157350 Sobic005G108501--Sobic001G318366 Sobic002G081000 Sobic002G081000 Sobic005G108501--Sobic002G081000 Sobic005G108501--Sobic003G429101 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic005G108501--Sobic001G272300 Sobic004G163000--Sobic009G184600 Sobic010G202900 Sobic010G202900 Sobic004G163000--Sobic010G202900 Sobic004G163000--Sobic010G103000 Sobic010G012100 Sobic010G012100 Sobic004G163000--Sobic010G012100 Sobic001G524600 Sobic001G524600 Sobic004G163000--Sobic001G524600 Sobic001G535000 Sobic001G535000 Sobic004G163000--Sobic001G535000 Sobic003G399900 Sobic003G399900 Sobic004G163000--Sobic003G399900 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic004G163000--Sobic006G053500 Sobic010G248100 Sobic010G248100 Sobic004G163000--Sobic010G248100 Sobic010G090800 Sobic010G090800 Sobic003G005400--Sobic010G090800 Sobic006G278950 Sobic006G278950 Sobic003G005400--Sobic006G278950 Sobic003G005400--Sobic003G429101 Sobic006G084100 Sobic006G084100 Sobic003G005400--Sobic006G084100 Sobic003G242600 Sobic003G242600 Sobic003G005400--Sobic003G242600 Sobic001G211000 Sobic001G211000 Sobic003G005400--Sobic001G211000 Sobic003G046900 Sobic003G046900 Sobic003G005400--Sobic003G046900 Sobic001G388100 Sobic001G388100 Sobic003G005400--Sobic001G388100 Sobic009G150800 Sobic009G150800 Sobic003G005400--Sobic009G150800 Sobic003G429101--Sobic003G046900 Sobic010G212900 Sobic010G212900 Sobic003G429101--Sobic010G212900 Sobic003G429101--Sobic001G220066 Sobic003G429101--Sobic002G348200 Sobic003G429101--Sobic002G157350 Sobic004G196000 Sobic004G196000 Sobic003G429101--Sobic004G196000 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic003G429101--Sobic009G214700 Sobic006G149650 Sobic006G149650 Sobic003G429101--Sobic006G149650 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G429101--Sobic008G192200 Sobic009G184600--Sobic010G012100 Sobic005G180900 Sobic005G180900 Sobic009G184600--Sobic005G180900 Sobic006G177200 Sobic006G177200 Sobic009G184600--Sobic006G177200 Sobic003G309050 Sobic003G309050 Sobic009G184600--Sobic003G309050 Sobic001G097200 Sobic001G097200 Sobic009G184600--Sobic001G097200 Sobic006G176800 Sobic006G176800 Sobic009G184600--Sobic006G176800 Sobic001G491700 Sobic001G491700 Sobic009G184600--Sobic001G491700 Sobic004G010200 Sobic004G010200 Sobic009G184600--Sobic004G010200 Sobic004G342300 Sobic004G342300 Sobic009G184600--Sobic004G342300 Sobic002G348200--Sobic001G220066 Sobic002G348200--Sobic002G157350 Sobic002G348200--Sobic001G272300 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic010G103000--Sobic007G075200 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic010G103000--Sobic006G261000 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic010G103000--Sobic002G213050 Sobic001G528000 Sobic001G528000 Sobic010G103000--Sobic001G528000 Sobic004G078400 Sobic004G078400 Sobic010G103000--Sobic004G078400 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic010G103000--Sobic003G049100 Sobic003G188900 Sobic003G188900 Sobic010G103000--Sobic003G188900 Sobic010G103000--Sobic006G053500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G103000--Sobic005G199500
Octagon: transcription factors


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