Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G010200.3,Sobic.004G010200.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YM69
Pfam PF14694 PF14695
Panther DB PTHR16057 PTHR16057:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032274 , Zm00025a035070 , Zm00025a013892
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G027900 - -
3 Sobic.010G057500 expressed protein K11138: telomere-associated protein RIF1
4 Sobic.003G309050 - -
5 Sobic.002G105700 protein binding protein, putative, expressed K19042: E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
6 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
7 Sobic.001G286500 expressed protein -
8 Sobic.002G374300 FAR1 family protein, expressed K17604: zinc finger SWIM domain-containing protein 3
9 Sobic.002G371600 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed K16572: TUBGCP5, gamma-tubulin complex component 5
10 Sobic.002G372500 exportin 1, putative, expressed K14288: exportin-T
11 Sobic.007G018400 expressed protein -
12 Sobic.004G010500 OsFBX52 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G098400 expressed protein K16278: E3 ubiquitin-protein ligase HOS1
14 Sobic.003G052800 RST1, putative, expressed -
15 Sobic.001G501800 ZOS1-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
16 Sobic.001G542450 - -
17 Sobic.006G080400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11851: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
18 Sobic.003G039000 GPI transamidase component Gpi16 subunit family protein, putative, expressed K05292: GPI-anchor transamidase subunit T
19 Sobic.004G213800 expressed protein -
20 Sobic.001G087600 ZOS9-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G010200 Sobic004G010200 Sobic003G217200 Sobic003G217200 Sobic004G010200--Sobic003G217200 Sobic010G027900 Sobic010G027900 Sobic004G010200--Sobic010G027900 Sobic010G057500 Sobic010G057500 Sobic004G010200--Sobic010G057500 Sobic003G309050 Sobic003G309050 Sobic004G010200--Sobic003G309050 Sobic002G105700 Sobic002G105700 Sobic004G010200--Sobic002G105700 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic004G010200--Sobic003G388000 Sobic001G286500 Sobic001G286500 Sobic004G010200--Sobic001G286500 Sobic002G374300 Sobic002G374300 Sobic004G010200--Sobic002G374300 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic004G010200--Sobic002G371600 Sobic001G542450 Sobic001G542450 Sobic003G217200--Sobic001G542450 Sobic003G052800 Sobic003G052800 Sobic003G217200--Sobic003G052800 Sobic003G217200--Sobic002G371600 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic003G217200--Sobic006G269800 Sobic003G217200--Sobic002G374300 Sobic008G088875 Sobic008G088875 Sobic003G217200--Sobic008G088875 Sobic001G087600 Sobic001G087600 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Octagon: transcription factors


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