Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G010500.1
Synonym
Functional annotation OsFBX52 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A2U9QI41 , A0A194YM37
Pfam -
Panther DB PTHR32133
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13200 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g33840.1 : OsFBX52 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G346900 RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed K14292: trimethylguanosine synthase
2 Sobic.007G102500 - -
3 Sobic.002G127900 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
4 Sobic.005G108000 - -
5 Sobic.005G045700 PHD-finger family protein, expressed -
6 Sobic.010G264900 OsFBX79 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G252100 methyl-binding domain protein MBD, putative, expressed -
8 Sobic.002G127200 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
9 Sobic.006G245900 FAR1 family protein, expressed -
10 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G262501 - -
12 Sobic.004G049700 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
13 Sobic.005G178800 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G098400 expressed protein K16278: E3 ubiquitin-protein ligase HOS1
15 Sobic.010G233000 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
16 Sobic.002G381900 expressed protein -
17 Sobic.003G368901 - -
18 Sobic.004G086200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
19 Sobic.005G178950 - -
20 Sobic.007G187600 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G010500 Sobic004G010500 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic004G010500--Sobic001G346900 Sobic007G102500 Sobic007G102500 Sobic004G010500--Sobic007G102500 Sobic002G127900 Sobic002G127900 Sobic004G010500--Sobic002G127900 Sobic005G108000 Sobic005G108000 Sobic004G010500--Sobic005G108000 Sobic005G045700 Sobic005G045700 Sobic004G010500--Sobic005G045700 Sobic010G264900 Sobic010G264900 Sobic004G010500--Sobic010G264900 Sobic002G252100 Sobic002G252100 Sobic004G010500--Sobic002G252100 Sobic002G127200 Sobic002G127200 Sobic004G010500--Sobic002G127200 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic004G010500--Sobic006G245900 Sobic004G086200 Sobic004G086200 Sobic001G346900--Sobic004G086200 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic001G346900--Sobic003G409200 Sobic001G134300 Sobic001G134300 Sobic001G346900--Sobic001G134300 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic001G346900--Sobic003G042400 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic001G346900--Sobic008G147200 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic001G346900--Sobic004G285000 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic001G346900--Sobic003G416700 Sobic010G096000 Sobic010G096000 Sobic001G346900--Sobic010G096000 Sobic002G422100 Sobic002G422100 Sobic001G346900--Sobic002G422100 Sobic007G102500--Sobic006G245900 Sobic007G102500--Sobic004G010500 Sobic007G102500--Sobic002G252100 Sobic003G123100 Sobic003G123100 Sobic007G102500--Sobic003G123100 Sobic004G247100 Sobic004G247100 Sobic007G102500--Sobic004G247100 Sobic007G102500--Sobic002G127200 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic007G102500--Sobic010G262100 Sobic002G043000 Sobic002G043000 Sobic007G102500--Sobic002G043000 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic007G102500--Sobic006G112700 Sobic002G127900--Sobic005G045700 Sobic008G165300 Sobic008G165300 Sobic002G127900--Sobic008G165300 Sobic007G053100 Sobic007G053100 Sobic002G127900--Sobic007G053100 Sobic003G368901 Sobic003G368901 Sobic002G127900--Sobic003G368901 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic002G127900--Sobic002G266300 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic002G127900--Sobic006G262501 Sobic002G127900--Sobic010G264900 Sobic009G155900 Sobic009G155900 Sobic002G127900--Sobic009G155900 Sobic001G125300 Sobic001G125300 Sobic002G127900--Sobic001G125300 Sobic005G108000--Sobic001G346900 Sobic005G108000--Sobic002G127200 Sobic004G224600 Sobic004G224600 Sobic005G108000--Sobic004G224600 Sobic006G178100 Sobic006G178100 Sobic005G108000--Sobic006G178100 Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic005G108000--Sobic002G171300 Sobic009G211200 Sobic009G211200 Sobic005G108000--Sobic009G211200 Sobic010G080550 Sobic010G080550 Sobic005G108000--Sobic010G080550 Sobic006G002800 Sobic006G002800 Sobic005G108000--Sobic006G002800 Sobic005G108000--Sobic006G245900 Sobic005G045700--Sobic002G127900 Sobic005G045700--Sobic007G053100 Sobic005G045700--Sobic002G266300 Sobic002G054400 Sobic002G054400 Sobic005G045700--Sobic002G054400 Sobic005G045700--Sobic003G368901 Sobic005G045700--Sobic001G125300 Sobic009G012600 Sobic009G012600 Sobic005G045700--Sobic009G012600 Sobic008G191850 Sobic008G191850 Sobic005G045700--Sobic008G191850 Sobic005G045700--Sobic006G262501 Sobic010G264900--Sobic005G045700 Sobic010G264900--Sobic002G127900 Sobic010G264900--Sobic003G368901 Sobic010G264900--Sobic004G010500 Sobic010G264900--Sobic006G262501 Sobic008G165266 Sobic008G165266 Sobic010G264900--Sobic008G165266 Sobic010G003900 Sobic010G003900 Sobic010G264900--Sobic010G003900 Sobic009G224300 Sobic009G224300 Sobic010G264900--Sobic009G224300 Sobic010G264900--Sobic009G155900 Sobic002G252100--Sobic006G245900 Sobic002G252100--Sobic003G123100 Sobic001G239800 Sobic001G239800 Sobic002G252100--Sobic001G239800 Sobic002G252100--Sobic001G346900 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic002G252100--Sobic002G371600 Sobic006G270600 Sobic006G270600 Sobic002G252100--Sobic006G270600 Sobic001G098400 Sobic001G098400 Sobic002G252100--Sobic001G098400 Sobic004G315500 Sobic004G315500 Sobic002G252100--Sobic004G315500 Sobic007G014800 Sobic007G014800 Sobic002G252100--Sobic007G014800 Sobic002G127200--Sobic001G346900 Sobic006G154100 Sobic006G154100 Sobic002G127200--Sobic006G154100 Sobic002G127200--Sobic005G108000 Sobic002G127200--Sobic010G080550 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic002G127200--Sobic003G312700 Sobic004G085000 Sobic004G085000 Sobic002G127200--Sobic004G085000 Sobic002G127200--Sobic004G086200 Sobic002G127200--Sobic003G416700 Sobic003G230600 Sobic003G230600 Sobic002G127200--Sobic003G230600 Sobic006G245900--Sobic002G371600 Sobic002G296400 Sobic002G296400 Sobic006G245900--Sobic002G296400 Sobic004G031300 Sobic004G031300 Sobic006G245900--Sobic004G031300 Sobic007G016900 Sobic007G016900 Sobic006G245900--Sobic007G016900 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic006G245900--Sobic002G292800 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic006G245900--Sobic007G145400 Sobic006G245900--Sobic002G252100 Sobic003G308500 Sobic003G308500 Sobic006G245900--Sobic003G308500 Sobic006G245900--Sobic001G346900
Octagon: transcription factors


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