Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G285500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QLM2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G285600 - -
2 Sobic.003G435300 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
3 Sobic.008G120920 - -
4 Sobic.008G130800 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
5 Sobic.010G130601 - -
6 Sobic.004G116400 OsFBK5 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
7 Sobic.003G348100 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G046800 expressed protein -
9 Sobic.002G111100 expressed protein -
10 Sobic.002G135000 expressed protein -
11 Sobic.003G179950 - -
12 Sobic.010G124900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
13 Sobic.001G225900 - -
14 Sobic.003G358600 similar to Phosphorylase(PubMedID : 29862293)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@alpha-glucan phosphorylast isozyme, putative, expressed K00688: PYG, glycogen phosphorylase
15 Sobic.006G177700 uncharacterized mscS family protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G174750 - -
17 Sobic.010G145100 - -
18 Sobic.004G145701 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
19 Sobic.002G226800 protein phosphotase protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G167600 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G285500 Sobic001G285500 Sobic001G285600 Sobic001G285600 Sobic001G285500--Sobic001G285600 Sobic003G435300 Sobic003G435300 Sobic001G285500--Sobic003G435300 Sobic008G120920 Sobic008G120920 Sobic001G285500--Sobic008G120920 Sobic008G130800 Sobic008G130800 Sobic001G285500--Sobic008G130800 Sobic010G130601 Sobic010G130601 Sobic001G285500--Sobic010G130601 Sobic004G116400 Sobic004G116400 Sobic001G285500--Sobic004G116400 Sobic003G348100 Sobic003G348100 Sobic001G285500--Sobic003G348100 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic001G285500--Sobic004G046800 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic001G285500--Sobic002G111100 Sobic001G285600--Sobic010G130601 Sobic003G179950 Sobic003G179950 Sobic001G285600--Sobic003G179950 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic001G285600--Sobic010G124900 Sobic001G285600--Sobic001G285500 Sobic006G177700 Sobic006G177700 Sobic001G285600--Sobic006G177700 Sobic001G285600--Sobic004G046800 Sobic001G285600--Sobic008G120920 Sobic006G117700 Sobic006G117700 Sobic001G285600--Sobic006G117700 Sobic001G167600 Sobic001G167600 Sobic001G285600--Sobic001G167600 Sobic008G054700 Sobic008G054700 Sobic003G435300--Sobic008G054700 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic003G435300--Sobic006G265800 Sobic001G539400 Sobic001G539400 Sobic003G435300--Sobic001G539400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic003G435300--Sobic010G153400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic003G435300--Sobic003G358600 Sobic003G435300--Sobic008G120920 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic003G435300--Sobic001G384200 Sobic009G220700 Sobic009G220700 Sobic003G435300--Sobic009G220700 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic003G435300--Sobic001G400000 Sobic008G120920--Sobic002G111100 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic008G120920--Sobic008G055200 Sobic008G120920--Sobic004G046800 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic008G120920--Sobic005G002100 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic008G120920--Sobic003G244400 Sobic005G136100 Sobic005G136100 Sobic008G120920--Sobic005G136100 Sobic001G103100 Sobic001G103100 Sobic008G120920--Sobic001G103100 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic008G120920--Sobic003G290500 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic008G120920--Sobic004G358000 Sobic008G130800--Sobic010G130601 Sobic006G086800 Sobic006G086800 Sobic008G130800--Sobic006G086800 Sobic008G130800--Sobic001G285600 Sobic008G130800--Sobic001G285500 Sobic001G225900 Sobic001G225900 Sobic008G130800--Sobic001G225900 Sobic008G130800--Sobic010G124900 Sobic002G135000 Sobic002G135000 Sobic008G130800--Sobic002G135000 Sobic004G162500 Sobic004G162500 Sobic008G130800--Sobic004G162500 Sobic010G277700 Sobic010G277700 Sobic008G130800--Sobic010G277700 Sobic010G130601--Sobic010G124900 Sobic010G130601--Sobic006G117700 Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic010G130601--Sobic001G405100 Sobic010G130601--Sobic002G111100 Sobic010G130601--Sobic001G167600 Sobic010G130601--Sobic006G177700 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic010G130601--Sobic003G024100 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic010G130601--Sobic008G136601 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic010G130601--Sobic006G001100 Sobic004G116400--Sobic001G400000 Sobic004G116400--Sobic004G046800 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic004G116400--Sobic005G050400 Sobic004G145701 Sobic004G145701 Sobic004G116400--Sobic004G145701 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic004G116400--Sobic001G112600 Sobic002G054700 Sobic002G054700 Sobic004G116400--Sobic002G054700 Sobic004G116400--Sobic008G120920 Sobic004G116400--Sobic008G054700 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic004G116400--Sobic004G113600 Sobic003G348100--Sobic001G400000 Sobic004G253200 Sobic004G253200 Sobic003G348100--Sobic004G253200 Sobic008G055600 Sobic008G055600 Sobic003G348100--Sobic008G055600 Sobic003G348100--Sobic008G120920 Sobic003G348100--Sobic001G112600 Sobic003G348100--Sobic003G244400 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic003G348100--Sobic003G441000 Sobic010G189432 Sobic010G189432 Sobic003G348100--Sobic010G189432 Sobic003G348100--Sobic004G046800 Sobic004G046800--Sobic008G055200 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic004G046800--Sobic001G194800 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic004G046800--Sobic001G106800 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic004G046800--Sobic002G192800 Sobic004G046800--Sobic008G120920 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic004G046800--Sobic008G029800 Sobic004G046800--Sobic010G124900 Sobic001G117100 Sobic001G117100 Sobic004G046800--Sobic001G117100 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic004G046800--Sobic008G030501 Sobic002G111100--Sobic001G106800 Sobic002G030300 Sobic002G030300 Sobic002G111100--Sobic002G030300 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic002G111100--Sobic002G372000 Sobic001G254000 Sobic001G254000 Sobic002G111100--Sobic001G254000 Sobic002G384500 Sobic002G384500 Sobic002G111100--Sobic002G384500 Sobic008G056700 Sobic008G056700 Sobic002G111100--Sobic008G056700 Sobic002G111100--Sobic010G124900 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic002G111100--Sobic003G243300 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic002G111100--Sobic002G295800
Octagon: transcription factors


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