Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G135000.1,Sobic.002G135000.2
Synonym Sb02g012020
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X5Y8
Pfam -
Panther DB PTHR36393
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20130 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39474.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046178
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G018651 - -
2 Sobic.010G130601 - -
3 Sobic.010G124900 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
4 Sobic.003G391000 lipase, putative, expressed -
5 Sobic.005G174750 - -
6 Sobic.002G226800 protein phosphotase protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G046800 expressed protein -
8 Sobic.005G041450 - -
9 Sobic.003G044300 D-tyrosyl-tRNA, putative, expressed K07560: dtd, D-aminoacyl-tRNA deacylase
10 Sobic.007G212500 nodulation protein-related, putative, expressed -
11 Sobic.006G204400 maltose excess protein 1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -
12 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0
13 Sobic.004G145701 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
14 Sobic.010G145100 - -
15 Sobic.001G106800 DUF221 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G111100 expressed protein -
17 Sobic.007G112832 - -
18 Sobic.008G120920 - -
19 Sobic.004G103901 - -
20 Sobic.005G200100 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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