Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G334001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8Y8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38695 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g27070.1 : E2F-related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018945
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G127300 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G090850 - -
3 Sobic.007G077600 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
4 Sobic.009G149000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
5 Sobic.001G152360 - -
6 Sobic.002G212100 - -
7 Sobic.009G135400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G330400 - -
9 Sobic.004G206500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
10 Sobic.005G183700 transferase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G164700 expressed protein -
12 Sobic.004G248700 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
13 Sobic.007G197500 expressed protein -
14 Sobic.003G236100 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.004G074100 expressed protein -
16 Sobic.002G416300 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
17 Sobic.001G469300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cupin domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G031400 expressed protein K18633: MZT1, GIP1, mitotic-spindle organizing protein 1
19 Sobic.009G247500 DUF623 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G242400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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