Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G127300.2
Synonym Sb08g017860
Functional annotation OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R788
Pfam -
Panther DB PTHR31264 PTHR31264:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36870.1 : OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G152360 - -
2 Sobic.010G223800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.006G154600 expressed protein -
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10 Sobic.010G241600 RNASEH2A - Putative ribonuclease H2 large subunit, expressed K10743: ribonuclease H2 subunit A
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13 Sobic.002G035400 - -
14 Sobic.009G178550 - -
15 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G466600 expressed protein -
17 Sobic.010G008300 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G170500 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
19 Sobic.003G321800 OsFBL3 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.010G137366 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G127300 Sobic008G127300 Sobic001G152360 Sobic001G152360 Sobic008G127300--Sobic001G152360 Sobic010G223800 Sobic010G223800 Sobic008G127300--Sobic010G223800 Sobic001G031400 Sobic001G031400 Sobic008G127300--Sobic001G031400 Sobic001G334001 Sobic001G334001 Sobic008G127300--Sobic001G334001 Sobic005G186200 Sobic005G186200 Sobic008G127300--Sobic005G186200 Sobic001G207633 Sobic001G207633 Sobic008G127300--Sobic001G207633 Sobic004G051401 Sobic004G051401 Sobic008G127300--Sobic004G051401 Sobic006G154600 Sobic006G154600 Sobic008G127300--Sobic006G154600 Sobic005G203700 Sobic005G203700 Sobic008G127300--Sobic005G203700 Sobic001G466600 Sobic001G466600 Sobic001G152360--Sobic001G466600 Sobic001G033600 Sobic001G033600 Sobic001G152360--Sobic001G033600 Sobic010G246300 Sobic010G246300 Sobic001G152360--Sobic010G246300 Sobic009G250600 Sobic009G250600 Sobic001G152360--Sobic009G250600 Sobic010G206501 Sobic010G206501 Sobic001G152360--Sobic010G206501 Sobic010G241600 Sobic010G241600 Sobic001G152360--Sobic010G241600 Sobic003G133300 Sobic003G133300 Sobic001G152360--Sobic003G133300 Sobic001G252600 Sobic001G252600 Sobic001G152360--Sobic001G252600 Sobic001G180700 Sobic001G180700 Sobic001G152360--Sobic001G180700 Sobic001G246900 Sobic001G246900 Sobic010G223800--Sobic001G246900 Sobic001G539300 Sobic001G539300 Sobic010G223800--Sobic001G539300 Sobic010G156400 Sobic010G156400 Sobic010G223800--Sobic010G156400 Sobic004G138900 Sobic004G138900 Sobic010G223800--Sobic004G138900 Sobic001G336050 Sobic001G336050 Sobic001G031400--Sobic001G336050 Sobic006G251701 Sobic006G251701 Sobic001G031400--Sobic006G251701 Sobic007G184001 Sobic007G184001 Sobic001G031400--Sobic007G184001 Sobic003G289601 Sobic003G289601 Sobic001G031400--Sobic003G289601 Sobic006G099800 Sobic006G099800 Sobic001G031400--Sobic006G099800 Sobic007G022500 Sobic007G022500 Sobic001G031400--Sobic007G022500 Sobic009G224600 Sobic009G224600 Sobic001G031400--Sobic009G224600 Sobic002G376500 Sobic002G376500 Sobic001G031400--Sobic002G376500 Sobic010G042800 Sobic010G042800 Sobic001G031400--Sobic010G042800 Sobic001G334001--Sobic008G127300 Sobic010G090850 Sobic010G090850 Sobic001G334001--Sobic010G090850 Sobic007G077600 Sobic007G077600 Sobic001G334001--Sobic007G077600 Sobic009G149000 Sobic009G149000 Sobic001G334001--Sobic009G149000 Sobic001G334001--Sobic001G152360 Sobic002G212100 Sobic002G212100 Sobic001G334001--Sobic002G212100 Sobic009G135400 Sobic009G135400 Sobic001G334001--Sobic009G135400 Sobic003G330400 Sobic003G330400 Sobic001G334001--Sobic003G330400 Sobic004G206500 Sobic004G206500 Sobic001G334001--Sobic004G206500 Sobic001G446500 Sobic001G446500 Sobic005G186200--Sobic001G446500 Sobic004G203200 Sobic004G203200 Sobic005G186200--Sobic004G203200 Sobic004G332500 Sobic004G332500 Sobic005G186200--Sobic004G332500 Sobic002G266400 Sobic002G266400 Sobic005G186200--Sobic002G266400 Sobic003G364500 Sobic003G364500 Sobic005G186200--Sobic003G364500 Sobic002G035400 Sobic002G035400 Sobic005G186200--Sobic002G035400 Sobic005G186200--Sobic001G207633 Sobic001G442600 Sobic001G442600 Sobic005G186200--Sobic001G442600 Sobic002G012400 Sobic002G012400 Sobic005G186200--Sobic002G012400 Sobic001G207633--Sobic005G186200 Sobic001G207633--Sobic010G223800 Sobic006G056300 Sobic006G056300 Sobic001G207633--Sobic006G056300 Sobic009G048201 Sobic009G048201 Sobic001G207633--Sobic009G048201 Sobic001G207633--Sobic010G246300 Sobic003G414900 Sobic003G414900 Sobic001G207633--Sobic003G414900 Sobic005G183700 Sobic005G183700 Sobic001G207633--Sobic005G183700 Sobic005G228250 Sobic005G228250 Sobic001G207633--Sobic005G228250 Sobic003G299100 Sobic003G299100 Sobic001G207633--Sobic003G299100 Sobic003G136200 Sobic003G136200 Sobic004G051401--Sobic003G136200 Sobic003G034600 Sobic003G034600 Sobic004G051401--Sobic003G034600 Sobic002G385400 Sobic002G385400 Sobic004G051401--Sobic002G385400 Sobic001G189000 Sobic001G189000 Sobic004G051401--Sobic001G189000 Sobic006G274400 Sobic006G274400 Sobic004G051401--Sobic006G274400 Sobic002G162300 Sobic002G162300 Sobic004G051401--Sobic002G162300 Sobic003G307400 Sobic003G307400 Sobic004G051401--Sobic003G307400 Sobic006G050800 Sobic006G050800 Sobic004G051401--Sobic006G050800 Sobic003G153600 Sobic003G153600 Sobic004G051401--Sobic003G153600 Sobic010G058800 Sobic010G058800 Sobic006G154600--Sobic010G058800 Sobic004G064900 Sobic004G064900 Sobic006G154600--Sobic004G064900 Sobic003G140000 Sobic003G140000 Sobic006G154600--Sobic003G140000 Sobic006G208800 Sobic006G208800 Sobic006G154600--Sobic006G208800 Sobic002G022400 Sobic002G022400 Sobic006G154600--Sobic002G022400 Sobic004G133500 Sobic004G133500 Sobic006G154600--Sobic004G133500 Sobic002G136600 Sobic002G136600 Sobic006G154600--Sobic002G136600 Sobic003G174700 Sobic003G174700 Sobic006G154600--Sobic003G174700 Sobic004G325700 Sobic004G325700 Sobic006G154600--Sobic004G325700 Sobic009G178550 Sobic009G178550 Sobic005G203700--Sobic009G178550 Sobic005G203700--Sobic001G539300 Sobic005G203700--Sobic010G156400 Sobic005G011900 Sobic005G011900 Sobic005G203700--Sobic005G011900
Octagon: transcription factors


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