Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G334200.1
Synonym Sb01g032270
Functional annotation nodulin, putative, expressed
UniProt C5WWI3
Pfam PF00892
Panther DB PTHR31218 PTHR31218:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18200 : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05530.1 : nodulin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002891
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G080190.1 , HORVU4Hr1G080190.4 , HORVU4Hr1G080190.5 , HORVU4Hr1G080190.6
Wheat TraesCS4B02G316400 , TraesCS4B02G316400 , TraesCS4A02G415600 , TraesCS4D02G313000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G334200 Sobic001G334200 Sobic005G188200 Sobic005G188200 Sobic001G334200--Sobic005G188200 Sobic003G170032 Sobic003G170032 Sobic001G334200--Sobic003G170032 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic001G334200--Sobic005G134501 Sobic003G321800 Sobic003G321800 Sobic001G334200--Sobic003G321800 Sobic010G193400 Sobic010G193400 Sobic001G334200--Sobic010G193400 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic001G334200--Sobic002G216801 Sobic004G136800 Sobic004G136800 Sobic001G334200--Sobic004G136800 Sobic003G145800 Sobic003G145800 Sobic001G334200--Sobic003G145800 Sobic009G023300 Sobic009G023300 Sobic001G334200--Sobic009G023300 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic005G188200--Sobic008G121400 Sobic008G104100 Sobic008G104100 Sobic005G188200--Sobic008G104100 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic005G188200--Sobic008G092932 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic005G188200--Sobic007G101900 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic005G188200--Sobic010G110266 Sobic010G136400 Sobic010G136400 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Octagon: transcription factors


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