Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G337600.1,Sobic.001G337600.2
Synonym Sb01g032530
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WWK9
Pfam -
Panther DB PTHR37760 PTHR37760:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15802 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g30092.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G337600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G099000 expressed protein -
2 Sobic.004G255500 SET domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G055800 expressed protein -
4 Sobic.005G036100 phosphoglycerate mutase, putative, expressed K15634: 2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase
5 Sobic.001G122400 ribosomal protein S13p/S18e, putative, expressed K02952: RP-S13, small subunit ribosomal protein S13
6 Sobic.006G107600 plastid-specific 30S ribosomal protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed K19032: 30S ribosomal protein 3
7 Sobic.003G386300 expressed protein -
8 Sobic.003G162900 expressed protein -
9 Sobic.003G077400 peptidase M50 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G081500 glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00006: glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+)
11 Sobic.001G469933 - K02946: RP-S10, MRPS10, small subunit ribosomal protein S10
12 Sobic.006G248200 - -
13 Sobic.001G391400 S1 RNA binding domain containing protein, expressed K02945: RP-S1, small subunit ribosomal protein S1
14 Sobic.002G109000 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G273400 pentatricopeptide repeat protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G495300 expressed protein -
17 Sobic.003G439000 rubredoxin family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G054100 spo0B-associated GTP-binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G002900 OsGrx_S16 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
20 Sobic.001G083100 Unnamed(PubMedID : 24676859)@WRKY4, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G337600 Sobic001G337600 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic001G337600--Sobic001G099000 Sobic004G255500 Sobic004G255500 Sobic001G337600--Sobic004G255500 Sobic009G055800 Sobic009G055800 Sobic001G337600--Sobic009G055800 Sobic005G036100 Sobic005G036100 Sobic001G337600--Sobic005G036100 Sobic001G122400 Sobic001G122400 Sobic001G337600--Sobic001G122400 Sobic006G107600 Sobic006G107600 Sobic001G337600--Sobic006G107600 Sobic003G386300 Sobic003G386300 Sobic001G337600--Sobic003G386300 Sobic003G162900 Sobic003G162900 Sobic001G337600--Sobic003G162900 Sobic003G077400 Sobic003G077400 Sobic001G337600--Sobic003G077400 Sobic002G158800 Sobic002G158800 Sobic001G099000--Sobic002G158800 Sobic005G184300 Sobic005G184300 Sobic001G099000--Sobic005G184300 Sobic007G015300 Sobic007G015300 Sobic001G099000--Sobic007G015300 Sobic002G081500 Sobic002G081500 Sobic001G099000--Sobic002G081500 Sobic001G099000--Sobic004G255500 Sobic010G027200 Sobic010G027200 Sobic001G099000--Sobic010G027200 Sobic002G109000 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Octagon: transcription factors


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