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Transcriptome id Sobic.001G455433.1
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UniProt A0A1Z5SAQ6
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G160400 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.001G373400 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed K01056: PTH1, pth, peptidyl-tRNA hydrolase, PTH1 family
3 Sobic.010G235800 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G250100 tRNA-specific adenosine deaminase 1, putative, expressed K15440: TAD1, tRNA-specific adenosine deaminase 1
6 Sobic.004G089500 - -
7 Sobic.005G191700 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13201: TIA1, nucleolysin TIA-1/TIAR
8 Sobic.003G070100 expressed protein -
9 Sobic.004G149800 transcriptional derepression of gliadins and low-molecular-weight glutenins (LMWgs) by active demethylation of their promoters(PubMedID : 23184965)@hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, expressed -
10 Sobic.007G216700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
11 Sobic.004G062800 - -
12 Sobic.002G330900 OsFBX462 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G125501 - -
14 Sobic.005G137700 OsFBX409 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G090300 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
16 Sobic.009G000400 expressed protein -
17 Sobic.005G020000 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.006G242401 - -
19 Sobic.008G029850 - -
20 Sobic.001G043400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G455433 Sobic001G455433 Sobic004G160400 Sobic004G160400 Sobic001G455433--Sobic004G160400 Sobic001G373400 Sobic001G373400 Sobic001G455433--Sobic001G373400 Sobic010G235800 Sobic010G235800 Sobic001G455433--Sobic010G235800 Sobic010G000100 Sobic010G000100 Sobic001G455433--Sobic010G000100 Sobic006G250100 Sobic006G250100 Sobic001G455433--Sobic006G250100 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic001G455433--Sobic004G089500 Sobic005G191700 Sobic005G191700 Sobic001G455433--Sobic005G191700 Sobic003G070100 Sobic003G070100 Sobic001G455433--Sobic003G070100 Sobic004G149800 Sobic004G149800 Sobic001G455433--Sobic004G149800 Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic004G160400--Sobic004G178901 Sobic008G125100 Sobic008G125100 Sobic004G160400--Sobic008G125100 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic004G160400--Sobic002G182150 Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic004G160400--Sobic004G148750 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic004G160400--Sobic005G099200 Sobic009G018450 Sobic009G018450 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Octagon: transcription factors


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