Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G242401.1,Sobic.006G242401.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFE0 , A0A1Z5RFI1
Pfam PF07000
Panther DB PTHR13379
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G73380 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009516
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1D02G173600 , TraesCS1D02G173600 , TraesCS1A02G167300 , TraesCS1B02G183700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G000400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G250100 tRNA-specific adenosine deaminase 1, putative, expressed K15440: TAD1, tRNA-specific adenosine deaminase 1
3 Sobic.006G248500 expressed protein -
4 Sobic.002G408600 expressed protein -
5 Sobic.001G522400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G469800 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
7 Sobic.002G224700 NFKB, putative, expressed -
8 Sobic.007G026000 ATBET9, putative, expressed -
9 Sobic.005G009200 expressed protein -
10 Sobic.002G262700 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13155: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein
11 Sobic.008G165100 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
12 Sobic.001G246500 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G100100 MYB family transcription factor, putative, expressed K12860: CDC5L, CDC5, pre-mRNA-splicing factor CDC5/CEF1
14 Sobic.009G074700 heat shock protein binding protein, putative, expressed K09540: SEC63, translocation protein SEC63
15 Sobic.007G210300 G-patch domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G362300 prefoldin, putative, expressed -
17 Sobic.009G042400 OsFBX159 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G279900 PHD-finger domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G222900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
20 Sobic.002G347700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G242401 Sobic006G242401 Sobic007G000400 Sobic007G000400 Sobic006G242401--Sobic007G000400 Sobic006G250100 Sobic006G250100 Sobic006G242401--Sobic006G250100 Sobic006G248500 Sobic006G248500 Sobic006G242401--Sobic006G248500 Sobic002G408600 Sobic002G408600 Sobic006G242401--Sobic002G408600 Sobic001G522400 Sobic001G522400 Sobic006G242401--Sobic001G522400 Sobic001G469800 Sobic001G469800 Sobic006G242401--Sobic001G469800 Sobic002G224700 Sobic002G224700 Sobic006G242401--Sobic002G224700 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G242401--Sobic007G026000 Sobic005G009200 Sobic005G009200 Sobic006G242401--Sobic005G009200 Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic007G000400--Sobic008G056900 Sobic007G000400--Sobic001G522400 Sobic007G000400--Sobic006G242401 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic007G000400--Sobic001G045700 Sobic009G096100 Sobic009G096100 Sobic007G000400--Sobic009G096100 Sobic002G380100 Sobic002G380100 Sobic007G000400--Sobic002G380100 Sobic004G128200 Sobic004G128200 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Octagon: transcription factors


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