Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G029850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4K9
Pfam PF10275
Panther DB PTHR12931 PTHR12931:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28120 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053807 , Zm00025a053809
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G090300 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
2 Sobic.001G373400 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed K01056: PTH1, pth, peptidyl-tRNA hydrolase, PTH1 family
3 Sobic.001G522400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G028700 expressed protein -
5 Sobic.006G237500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G147400 - -
7 Sobic.006G144000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G092066 - -
9 Sobic.009G000400 expressed protein -
10 Sobic.002G264600 GRAM domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G386900 pseudouridylate synthase, putative, expressed K06176: truD, tRNA pseudouridine13 synthase
12 Sobic.003G092033 - -
13 Sobic.006G131200 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03018: RPC1, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
14 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
15 Sobic.001G495400 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G040900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin
17 Sobic.004G068100 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
18 Sobic.001G472100 frigida, putative, expressed -
19 Sobic.004G106250 - -
20 Sobic.009G260650 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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