Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G463400.1
Synonym Sb01g043490
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WTR3
Pfam -
Panther DB PTHR33181 PTHR33181:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43150 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g10860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK23020
Barley -
Wheat TraesCS4B02G255700 , TraesCS4A02G049100 , TraesCS4D02G255800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G463400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G011800 SAM domain containing protein, putative, expressed -
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10 Sobic.004G275100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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18 Sobic.004G333300 serine-rich protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G133500 expressed protein -
20 Sobic.005G093400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G463400 Sobic001G463400 Sobic001G011800 Sobic001G011800 Sobic001G463400--Sobic001G011800 Sobic002G175900 Sobic002G175900 Sobic001G463400--Sobic002G175900 Sobic010G185600 Sobic010G185600 Sobic001G463400--Sobic010G185600 Sobic009G127300 Sobic009G127300 Sobic001G463400--Sobic009G127300 Sobic003G016400 Sobic003G016400 Sobic001G463400--Sobic003G016400 Sobic010G066300 Sobic010G066300 Sobic001G463400--Sobic010G066300 Sobic005G175300 Sobic005G175300 Sobic001G463400--Sobic005G175300 Sobic003G325500 Sobic003G325500 Sobic001G463400--Sobic003G325500 Sobic007G136700 Sobic007G136700 Sobic001G463400--Sobic007G136700 Sobic001G011800--Sobic009G127300 Sobic007G181600 Sobic007G181600 Sobic001G011800--Sobic007G181600 Sobic007G050300 Sobic007G050300 Sobic001G011800--Sobic007G050300 Sobic004G298700 Sobic004G298700 Sobic001G011800--Sobic004G298700 Sobic010G079800 Sobic010G079800 Sobic001G011800--Sobic010G079800 Sobic006G094500 Sobic006G094500 Sobic001G011800--Sobic006G094500 Sobic002G400400 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Octagon: transcription factors


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