Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G484900.1
Synonym Sb01g045390
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WVU5
Pfam -
Panther DB PTHR35758 PTHR35758:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G21910 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g07980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000891
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G076170.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G163100 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@B-box zinc finger family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G310700 glutaredoxin 2, putative, expressed -
3 Sobic.008G045450 - -
4 Sobic.006G111500 expressed protein -
5 Sobic.008G075900 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
6 Sobic.005G229500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G077700 hydrolase, NUDIX family, domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G132400 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.001G204501 - -
10 Sobic.009G230400 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
11 Sobic.003G211500 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G157000 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
13 Sobic.002G283800 AIG2-like family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G169400 expressed protein -
15 Sobic.005G003900 phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed K15892: farnesol kinase
16 Sobic.002G246600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G122900 expressed protein K15360: STRA13, CENPX, centromere protein X
18 Sobic.004G123600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@PPR repeat domain containing protein, putative, expressed K18213: proteinaceous RNase P
19 Sobic.010G267650 - -
20 Sobic.001G295600 myb-like transcription factor family protein(PubMedID : 26465154)@MYB family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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