Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G520500.1
Synonym Sb01g048540, BOB1
Functional annotation CS domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WZY5
Pfam PF04969
Panther DB PTHR12356 PTHR12356:SF3
NCBI CDD KOG2265; Nuclear distribution protein NUDC
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53400 : HSP20-like chaperones superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g12530.1 : CS domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042608 , Zm00025a049452
Brachypodium KQK18841 , KQK03016
Barley -
Wheat TraesCS7A02G189600 , TraesCS7A02G189600 , TraesCS7D02G190700 , TraesCS7D02G190700 , TraesCS7B02G094500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G290100 expressed protein K08739: DNA mismatch repair protein MLH3


Gene co-expression network
sample Sobic001G520500 Sobic001G520500 Sobic005G092301 Sobic005G092301 Sobic001G520500--Sobic005G092301 Sobic007G028900 Sobic007G028900 Sobic001G520500--Sobic007G028900 Sobic003G369600 Sobic003G369600 Sobic001G520500--Sobic003G369600 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic001G520500--Sobic001G499500 Sobic002G363700 Sobic002G363700 Sobic001G520500--Sobic002G363700 Sobic001G092200 Sobic001G092200 Sobic001G520500--Sobic001G092200 Sobic003G230700 Sobic003G230700 Sobic001G520500--Sobic003G230700 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic001G520500--Sobic008G141900 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic001G520500--Sobic003G435400 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic005G092301--Sobic003G275400 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic005G092301--Sobic008G191700 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic005G092301--Sobic010G211200 Sobic005G092301--Sobic008G141900 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic005G092301--Sobic004G222150 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic005G092301--Sobic002G064800 Sobic009G241900 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Octagon: transcription factors


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