Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G067500.1
Synonym PLP8, PLAIVD, Sb01g006140
Functional annotation PLA IIIA/PLP7, putative, expressed
UniProt C5WY87
Pfam PF01734
Panther DB PTHR32241 PTHR32241:SF6
NCBI CDD KOG0513; Ca2+-independent phospholipase A2
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54950 : patatin-like protein 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g57080.1 : PLA IIIA/PLP7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008446 , Zm00025a001621
Brachypodium KQK22522 , KQK14014 , KQK12883
Barley HORVU5Hr1G103060.4 , HORVU5Hr1G103060.3 , HORVU5Hr1G103060.2 , HORVU5Hr1G103060.1
Wheat TraesCS5D02G430300 , TraesCS5D02G430400 , TraesCS4D02G221300 , TraesCS5A02G422200 , TraesCS5B02G424100 , TraesCS4A02G083200 , TraesCS5A02G422000 , TraesCS4B02G221000 , TraesCS5B02G423900
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cDNA sequences
Sobic.001G067500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.010G252100 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
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19 Sobic.003G045450 - -
20 Sobic.005G212201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G067500 Sobic001G067500 Sobic002G420000 Sobic002G420000 Sobic001G067500--Sobic002G420000 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic001G067500--Sobic009G081800 Sobic001G239900 Sobic001G239900 Sobic001G067500--Sobic001G239900 Sobic008G017700 Sobic008G017700 Sobic001G067500--Sobic008G017700 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic001G067500--Sobic009G178500 Sobic004G038850 Sobic004G038850 Sobic001G067500--Sobic004G038850 Sobic009G012300 Sobic009G012300 Sobic001G067500--Sobic009G012300 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic001G067500--Sobic008G141900 Sobic001G530700 Sobic001G530700 Sobic001G067500--Sobic001G530700 Sobic002G394200 Sobic002G394200 Sobic002G420000--Sobic002G394200 Sobic001G295400 Sobic001G295400 Sobic002G420000--Sobic001G295400 Sobic007G008300 Sobic007G008300 Sobic002G420000--Sobic007G008300 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic002G420000--Sobic010G030000 Sobic008G131900 Sobic008G131900 Sobic002G420000--Sobic008G131900 Sobic010G222800 Sobic010G222800 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Octagon: transcription factors


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