Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G156200.2,Sobic.002G156200.1
Synonym Sb02g019530, NPQ7
Functional annotation DUF565 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QBK4 , C5X8A5
Pfam PF04483
Panther DB PTHR33787 PTHR33787:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65420 : Protein of unknown function (DUF565)
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g11520.1 : DUF565 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016644
Brachypodium PNT64307
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G156200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G351900 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K06689: UBE2D, UBC4, ubiquitin-conjugating enzyme E2 D
2 Sobic.009G070100 expressed protein -
3 Sobic.006G076601 - -
4 Sobic.010G056200 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G095500 expressed protein -
6 Sobic.004G083700 expressed protein -
7 Sobic.001G384900 hypothetical protein K09250: cellular nucleic acid-binding protein
8 Sobic.001G514100 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.002G309800 casein kinase II subunit beta-4, putative, expressed K03115: casein kinase II subunit beta
10 Sobic.006G252300 BSD domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G005600 SEC14 cytosolic factor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G116900 expressed protein -
13 Sobic.006G028300 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 2, putative, expressed -
14 Sobic.004G208600 glycine-rich protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G076700 coproporphyrinogen III oxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K00228: CPOX, coproporphyrinogen III oxidase
16 Sobic.001G291100 tetraspanin family protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G113000 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
18 Sobic.001G031300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
20 Sobic.009G114800 thioesterase family protein, putative, expressed K17362: acyl-coenzyme A thioesterase 13


Gene co-expression network
sample Sobic002G156200 Sobic002G156200 Sobic002G351900 Sobic002G351900 Sobic002G156200--Sobic002G351900 Sobic009G070100 Sobic009G070100 Sobic002G156200--Sobic009G070100 Sobic006G076601 Sobic006G076601 Sobic002G156200--Sobic006G076601 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic002G156200--Sobic010G056200 Sobic007G095500 Sobic007G095500 Sobic002G156200--Sobic007G095500 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic002G156200--Sobic004G083700 Sobic001G384900 Sobic001G384900 Sobic002G156200--Sobic001G384900 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic002G156200--Sobic001G514100 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic002G156200--Sobic002G309800 Sobic002G351900--Sobic010G056200 Sobic007G115200 Sobic007G115200 Sobic002G351900--Sobic007G115200 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic002G351900--Sobic010G005600 Sobic001G281600 Sobic001G281600 Sobic002G351900--Sobic001G281600 Sobic004G121100 Sobic004G121100 Sobic002G351900--Sobic004G121100 Sobic007G078500 Sobic007G078500 Sobic002G351900--Sobic007G078500 Sobic009G157200 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Octagon: transcription factors


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