Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G169766.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4N9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G038300 MBTB13 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
2 Sobic.009G095300 - -
3 Sobic.007G061100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
4 Sobic.003G163900 CC-NBS-LRR protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G221250 - -
6 Sobic.005G182000 - -
7 Sobic.007G106850 - -
8 Sobic.006G041866 - -
9 Sobic.001G500800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@4-coumarate--CoA ligase-like 7, putative, expressed K01904: 4-coumarate--CoA ligase
10 Sobic.002G145200 - -
11 Sobic.005G171400 expressed protein -
12 Sobic.009G110000 phospholipase D p1, putative, expressed -
13 Sobic.010G262500 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
14 Sobic.010G094100 - -
15 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
16 Sobic.007G105400 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10579: UBE2M, ubiquitin-conjugating enzyme E2 M
17 Sobic.001G236400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G144300 phospholipase, patatin family, putative, expressed -
19 Sobic.004G131900 - -
20 Sobic.007G202300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G169766 Sobic002G169766 Sobic006G038300 Sobic006G038300 Sobic002G169766--Sobic006G038300 Sobic009G095300 Sobic009G095300 Sobic002G169766--Sobic009G095300 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic002G169766--Sobic007G061100 Sobic003G163900 Sobic003G163900 Sobic002G169766--Sobic003G163900 Sobic005G221250 Sobic005G221250 Sobic002G169766--Sobic005G221250 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic002G169766--Sobic005G182000 Sobic007G106850 Sobic007G106850 Sobic002G169766--Sobic007G106850 Sobic006G041866 Sobic006G041866 Sobic002G169766--Sobic006G041866 Sobic001G500800 Sobic001G500800 Sobic002G169766--Sobic001G500800 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic006G038300--Sobic007G202300 Sobic008G187632 Sobic008G187632 Sobic006G038300--Sobic008G187632 Sobic009G101800 Sobic009G101800 Sobic006G038300--Sobic009G101800 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic006G038300--Sobic008G101100 Sobic006G038300--Sobic005G221250 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic006G038300--Sobic001G000300 Sobic006G038300--Sobic002G169766 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic006G038300--Sobic008G122100 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic006G038300--Sobic008G084300 Sobic009G095300--Sobic002G169766 Sobic009G095300--Sobic006G041866 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic009G095300--Sobic006G165600 Sobic002G339300 Sobic002G339300 Sobic009G095300--Sobic002G339300 Sobic010G079500 Sobic010G079500 Sobic009G095300--Sobic010G079500 Sobic004G025400 Sobic004G025400 Sobic009G095300--Sobic004G025400 Sobic010G022200 Sobic010G022200 Sobic009G095300--Sobic010G022200 Sobic006G049900 Sobic006G049900 Sobic009G095300--Sobic006G049900 Sobic003G193200 Sobic003G193200 Sobic009G095300--Sobic003G193200 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic007G061100--Sobic007G090403 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G061100--Sobic002G244200 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G061100--Sobic001G062900 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic007G061100--Sobic003G160100 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic007G061100--Sobic001G413000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic007G061100--Sobic004G086150 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic007G061100--Sobic009G248801 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic007G061100--Sobic002G017500 Sobic006G225900 Sobic006G225900 Sobic007G061100--Sobic006G225900 Sobic010G000600 Sobic010G000600 Sobic003G163900--Sobic010G000600 Sobic010G175500 Sobic010G175500 Sobic003G163900--Sobic010G175500 Sobic005G062900 Sobic005G062900 Sobic003G163900--Sobic005G062900 Sobic001G159400 Sobic001G159400 Sobic003G163900--Sobic001G159400 Sobic010G077400 Sobic010G077400 Sobic003G163900--Sobic010G077400 Sobic003G381200 Sobic003G381200 Sobic003G163900--Sobic003G381200 Sobic006G143000 Sobic006G143000 Sobic003G163900--Sobic006G143000 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic003G163900--Sobic001G252000 Sobic009G148900 Sobic009G148900 Sobic003G163900--Sobic009G148900 Sobic005G221250--Sobic008G187632 Sobic005G150350 Sobic005G150350 Sobic005G221250--Sobic005G150350 Sobic010G262500 Sobic010G262500 Sobic005G221250--Sobic010G262500 Sobic001G298700 Sobic001G298700 Sobic005G221250--Sobic001G298700 Sobic009G139000 Sobic009G139000 Sobic005G221250--Sobic009G139000 Sobic005G221250--Sobic005G182000 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic005G221250--Sobic009G161550 Sobic005G221250--Sobic003G160100 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic005G221250--Sobic003G061200 Sobic005G182000--Sobic009G161550 Sobic005G182000--Sobic009G139000 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic005G182000--Sobic010G141800 Sobic002G427050 Sobic002G427050 Sobic005G182000--Sobic002G427050 Sobic001G262700 Sobic001G262700 Sobic005G182000--Sobic001G262700 Sobic001G481900 Sobic001G481900 Sobic005G182000--Sobic001G481900 Sobic002G427000 Sobic002G427000 Sobic005G182000--Sobic002G427000 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic005G182000--Sobic004G091100 Sobic003G247300 Sobic003G247300 Sobic005G182000--Sobic003G247300 Sobic006G086500 Sobic006G086500 Sobic007G106850--Sobic006G086500 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic007G106850--Sobic003G170900 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic007G106850--Sobic001G300100 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic007G106850--Sobic003G166750 Sobic004G238900 Sobic004G238900 Sobic007G106850--Sobic004G238900 Sobic001G001900 Sobic001G001900 Sobic007G106850--Sobic001G001900 Sobic003G313500 Sobic003G313500 Sobic007G106850--Sobic003G313500 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic007G106850--Sobic009G165700 Sobic002G148750 Sobic002G148750 Sobic007G106850--Sobic002G148750 Sobic001G120600 Sobic001G120600 Sobic006G041866--Sobic001G120600 Sobic002G105700 Sobic002G105700 Sobic006G041866--Sobic002G105700 Sobic002G296500 Sobic002G296500 Sobic006G041866--Sobic002G296500 Sobic004G123400 Sobic004G123400 Sobic006G041866--Sobic004G123400 Sobic004G231900 Sobic004G231900 Sobic006G041866--Sobic004G231900 Sobic003G235400 Sobic003G235400 Sobic006G041866--Sobic003G235400 Sobic006G037200 Sobic006G037200 Sobic006G041866--Sobic006G037200 Sobic006G275100 Sobic006G275100 Sobic006G041866--Sobic006G275100 Sobic001G052600 Sobic001G052600 Sobic006G041866--Sobic001G052600 Sobic001G488700 Sobic001G488700 Sobic001G500800--Sobic001G488700 Sobic010G196500 Sobic010G196500 Sobic001G500800--Sobic010G196500 Sobic001G381200 Sobic001G381200 Sobic001G500800--Sobic001G381200 Sobic006G213500 Sobic006G213500 Sobic001G500800--Sobic006G213500 Sobic002G001000 Sobic002G001000 Sobic001G500800--Sobic002G001000 Sobic002G187700 Sobic002G187700 Sobic001G500800--Sobic002G187700 Sobic003G403500 Sobic003G403500 Sobic001G500800--Sobic003G403500 Sobic003G302800 Sobic003G302800 Sobic001G500800--Sobic003G302800 Sobic006G175800 Sobic006G175800 Sobic001G500800--Sobic006G175800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.