Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G095300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7T2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1A02G209500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G169766 - -
2 Sobic.006G041866 - -
3 Sobic.006G165600 - -
4 Sobic.002G339300 myosin-Vb, putative, expressed K10357: myosin V
5 Sobic.010G079500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G025400 phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.010G022200 - -
8 Sobic.006G049900 MYB family transcription factor, putative, expressed K09522: DnaJ homolog subfamily C member 2
9 Sobic.003G193200 expressed protein -
10 Sobic.006G167500 armadillo/beta-catenin-like repeat family protein, expressed -
11 Sobic.001G400500 calpain, putative, expressed -
12 Sobic.004G262700 - -
13 Sobic.007G106850 - -
14 Sobic.001G145000 expressed protein K14376: poly(A) polymerase
15 Sobic.007G103100 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
16 Sobic.004G144000 - -
17 Sobic.001G527800 DCL2, putative, expressed K11592: DICER1, endoribonuclease Dicer
18 Sobic.010G016600 CAMK_CAMK_like.6 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
19 Sobic.010G109600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@angel, putative, expressed -
20 Sobic.008G037800 ACT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G095300 Sobic009G095300 Sobic002G169766 Sobic002G169766 Sobic009G095300--Sobic002G169766 Sobic006G041866 Sobic006G041866 Sobic009G095300--Sobic006G041866 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic009G095300--Sobic006G165600 Sobic002G339300 Sobic002G339300 Sobic009G095300--Sobic002G339300 Sobic010G079500 Sobic010G079500 Sobic009G095300--Sobic010G079500 Sobic004G025400 Sobic004G025400 Sobic009G095300--Sobic004G025400 Sobic010G022200 Sobic010G022200 Sobic009G095300--Sobic010G022200 Sobic006G049900 Sobic006G049900 Sobic009G095300--Sobic006G049900 Sobic003G193200 Sobic003G193200 Sobic009G095300--Sobic003G193200 Sobic006G038300 Sobic006G038300 Sobic002G169766--Sobic006G038300 Sobic002G169766--Sobic009G095300 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic002G169766--Sobic007G061100 Sobic003G163900 Sobic003G163900 Sobic002G169766--Sobic003G163900 Sobic005G221250 Sobic005G221250 Sobic002G169766--Sobic005G221250 Sobic005G182000 Sobic005G182000 Sobic002G169766--Sobic005G182000 Sobic007G106850 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Octagon: transcription factors


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