Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G022200.8,Sobic.010G022200.3,Sobic.010G022200.5,Sobic.010G022200.7,Sobic.010G022200.6,Sobic.010G022200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YGX5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G022200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G413600 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08592: sentrin-specific protease 1
2 Sobic.001G126400 - K13179: DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18/HAS1
3 Sobic.003G434800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G038100 OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G110332 - -
6 Sobic.001G372200 - -
7 Sobic.005G029800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
8 Sobic.009G193200 - -
9 Sobic.002G105700 protein binding protein, putative, expressed K19042: E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
10 Sobic.005G008600 double-stranded RNA binding motif containing protein, expressed -
11 Sobic.003G208100 Mo25, putative, expressed -
12 Sobic.004G018700 expressed protein -
13 Sobic.010G190700 DUF1680 domain containing protein, putative, expressed K09955: uncharacterized protein
14 Sobic.004G276900 leucyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, putative, expressed K01869: LARS, leucyl-tRNA synthetase
15 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
16 Sobic.006G238400 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G306800 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.006G119400 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G031700 - -
20 Sobic.004G267900 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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