Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G372200.2,Sobic.001G372200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QN86
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G012100 smr domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G100700 mRNA-capping enzyme, putative, expressed -
3 Sobic.002G154000 EDM2, putative, expressed -
4 Sobic.001G063700 expressed protein -
5 Sobic.007G063000 expressed protein -
6 Sobic.009G256300 DNA binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G229500 ZOS12-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
8 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G123600 WW domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G146100 formin, putative, expressed -
11 Sobic.005G064000 SWIRM domain containing protein, expressed K11649: SWI/SNF related-matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C
12 Sobic.002G191800 - -
13 Sobic.005G112300 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative, expressed K11835: USP4_11, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4/11
14 Sobic.001G534700 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G062800 SET domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G405800 PHD-finger family protein, expressed -
17 Sobic.002G145101 - -
18 Sobic.003G360400 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08596: sentrin-specific protease 7
19 Sobic.004G209700 FAR1 family protein, expressed -
20 Sobic.003G372700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G372200 Sobic001G372200 Sobic003G012100 Sobic003G012100 Sobic001G372200--Sobic003G012100 Sobic005G100700 Sobic005G100700 Sobic001G372200--Sobic005G100700 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic001G372200--Sobic002G154000 Sobic001G063700 Sobic001G063700 Sobic001G372200--Sobic001G063700 Sobic007G063000 Sobic007G063000 Sobic001G372200--Sobic007G063000 Sobic009G256300 Sobic009G256300 Sobic001G372200--Sobic009G256300 Sobic003G229500 Sobic003G229500 Sobic001G372200--Sobic003G229500 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic001G372200--Sobic008G028700 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G372200--Sobic010G123600 Sobic004G048800 Sobic004G048800 Sobic003G012100--Sobic004G048800 Sobic002G299700 Sobic002G299700 Sobic003G012100--Sobic002G299700 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic003G012100--Sobic003G360400 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic003G012100--Sobic008G113100 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic003G012100--Sobic001G363500 Sobic001G026200 Sobic001G026200 Sobic003G012100--Sobic001G026200 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic003G012100--Sobic010G065300 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic003G012100--Sobic007G117400 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic003G012100--Sobic001G241200 Sobic005G100700--Sobic003G360400 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic005G100700--Sobic002G344000 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic005G100700--Sobic007G159900 Sobic003G389200 Sobic003G389200 Sobic005G100700--Sobic003G389200 Sobic005G100700--Sobic008G113100 Sobic007G146100 Sobic007G146100 Sobic005G100700--Sobic007G146100 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic005G100700--Sobic006G096900 Sobic001G456300 Sobic001G456300 Sobic005G100700--Sobic001G456300 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic005G100700--Sobic010G112100 Sobic002G154000--Sobic003G360400 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic002G154000--Sobic003G416700 Sobic002G154000--Sobic010G112100 Sobic002G154000--Sobic001G063700 Sobic010G001100 Sobic010G001100 Sobic002G154000--Sobic010G001100 Sobic001G461400 Sobic001G461400 Sobic002G154000--Sobic001G461400 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic002G154000--Sobic001G433800 Sobic002G154000--Sobic004G048800 Sobic002G154000--Sobic007G063000 Sobic001G063700--Sobic001G461400 Sobic001G063700--Sobic003G360400 Sobic001G063700--Sobic010G112100 Sobic001G063700--Sobic002G154000 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic001G063700--Sobic003G188400 Sobic001G063700--Sobic001G433800 Sobic001G063700--Sobic009G256300 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic001G063700--Sobic008G002500 Sobic001G354600 Sobic001G354600 Sobic001G063700--Sobic001G354600 Sobic007G063000--Sobic001G433800 Sobic003G196300 Sobic003G196300 Sobic007G063000--Sobic003G196300 Sobic007G063000--Sobic003G360400 Sobic009G109200 Sobic009G109200 Sobic007G063000--Sobic009G109200 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic007G063000--Sobic009G165700 Sobic007G063000--Sobic010G112100 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic007G063000--Sobic003G166750 Sobic004G242400 Sobic004G242400 Sobic007G063000--Sobic004G242400 Sobic007G063000--Sobic009G256300 Sobic009G256300--Sobic010G112100 Sobic009G256300--Sobic003G389200 Sobic009G256300--Sobic004G242400 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic009G256300--Sobic010G010700 Sobic009G256300--Sobic010G123600 Sobic009G256300--Sobic003G360400 Sobic009G256300--Sobic009G109200 Sobic004G276400 Sobic004G276400 Sobic009G256300--Sobic004G276400 Sobic001G542400 Sobic001G542400 Sobic009G256300--Sobic001G542400 Sobic008G132600 Sobic008G132600 Sobic003G229500--Sobic008G132600 Sobic007G062800 Sobic007G062800 Sobic003G229500--Sobic007G062800 Sobic003G101400 Sobic003G101400 Sobic003G229500--Sobic003G101400 Sobic001G196500 Sobic001G196500 Sobic003G229500--Sobic001G196500 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic003G229500--Sobic002G042600 Sobic003G229500--Sobic001G363500 Sobic001G347500 Sobic001G347500 Sobic003G229500--Sobic001G347500 Sobic003G072200 Sobic003G072200 Sobic003G229500--Sobic003G072200 Sobic001G540400 Sobic001G540400 Sobic003G229500--Sobic001G540400 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic010G279450 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic008G028700--Sobic009G040600 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G009600 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic008G028700--Sobic004G258700 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic008G028700--Sobic007G065400 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic010G139000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G006900 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic008G028700--Sobic002G145101 Sobic008G028700--Sobic008G113100 Sobic010G123600--Sobic010G010700 Sobic010G123600--Sobic009G256300 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic010G123600--Sobic003G170900 Sobic005G167700 Sobic005G167700 Sobic010G123600--Sobic005G167700 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic010G123600--Sobic005G112300 Sobic010G123600--Sobic001G433800 Sobic010G123600--Sobic010G112100 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic010G123600--Sobic001G194200 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic010G123600--Sobic008G001200
Octagon: transcription factors


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